（壹）物理消毒法
1．機械消毒法
壹般應用肥皂擦洗、流水沖洗，可消滅手上大部分甚至全部細菌，使用多層口罩可防止病原體從呼吸道排出或侵入。應用通風裝置過濾可使手術室、化驗室和隔離病房內的空氣潔凈，保障無菌狀態。
2.熱力消毒
包括火力、煮沸、流動蒸汽、高熱蒸汽、幹熱滅菌。可使病原體蛋白質凝固變性，失去正常代謝功能。
（1）焚燒法
凡經濟價值小的汙染物、金屬器械和屍體均可采用此法。簡單經濟，效果穩定。
（2）煮沸
耐煮沸的物品和壹般金屬器械均采用此法，100℃下1～2分鐘即可完成消毒，但芽胞則需較長的時間。炭疽桿菌芽胞必須煮沸 30 分鐘，破傷風芽胞需要 3 小時，肉毒桿菌芽胞需要 6 小時。金屬器械消毒時，可加入 1～2% 碳酸鈉或 0.5% 軟皂等堿性藥劑，能溶解脂肪，增強殺菌力。棉織品用 1%肥皂水 15l/kg，有消毒去汙作用。物品煮沸消毒時，體積不超過 3/4，應浸沒在水面下。註意留有空隙，以利對流。
（3）流動蒸汽消毒
相對濕度80～100%，溫度近100℃，利用水蒸氣凝結在物體表面等，釋放熱能，殺滅病原體。而當蒸汽凝聚收縮產生負壓時，推動外層熱蒸汽進入補充層，滲透到物品深處，加速散熱，促進消毒。
（4）高壓蒸汽殺菌
通常壓力為98.066kPa，溫度121～126℃，15～20分鐘即能徹底殺滅細菌病菌，適用於不耐高溫、潮濕的物品。
（5）幹熱滅菌
幹熱空氣傳導性差，熱容量小，穿透力弱，物體受熱慢。需160～170℃，1～2小時才能滅菌。適用於不能帶水的玻璃容器、金屬器械等。不同病原體的耐熱性，用熱死時間表示。
3.輻射滅菌
有非電離輻射和電離輻射兩種。前者有紫外線、紅外線和微波，後者包括高能電子束C射線（陰極射線）。紅外線和微波主要依靠熱能殺菌。
電離輻射設備價格昂貴，對物品和人體有壹定的危害，因此使用較少。目前使用最多的為紫外線，可引起細胞成分特別是核酸、血漿蛋白和酸性物質的改變，導致微生物死亡。紫外線的波長範圍為 2100 ～ 3280A，殺死微生物的波長為 2000 ～ 3000A，其中 2500 ～ 2650A 的效果最強。真菌孢子對紫外線的耐受性最強，細菌芽胞次之，細菌繁殖體最弱，只有少數例外。紫外線的穿透力很差，3000A 以下的紫外線無法穿過 2 毫米厚的普通玻璃。空氣中的灰塵和相對濕度會降低其殺菌效果。對水的穿透力隨深度和濁度的增加而減弱。但由於其使用方便，對藥品無害，因此被廣泛用於空氣和壹般物品表面的殺菌。照射人體會出現皮膚紅斑、紫外線眼炎和臭氧中毒。因此，人在使用時應避免或采取相應的防護措施。
日光照射也是依靠紫外線輻射，但由於在大氣中的散射和吸收作用，使用時只能達到地面的39%，因此只能對耐受力較低的微生物進行照射，而且必須照射較長時間。另外，過濾殺菌除了在實驗室應用外，只有在建築物通風、空氣過濾時才能使用，所以壹般消毒很難應用。
（二）化學消毒法
根據病原體蛋白質的作用，分為以下幾類。
1．凝固蛋白消毒劑，包括酚類、酸類和醇類。
（1）酚類
主要有苯酚、來蘇水、六六六等。有特殊氣味，殺菌力有限。可使紡織品褪色，橡膠制品變脆，對皮膚有壹定的刺激性，所以除來蘇爾外較少應用。苯酚（石碳酸）（carbolic acid）：無色晶體，有特殊氣味，遇潮呈粉紅色，但消毒力不減。對細胞漿毒，對細菌繁殖型1：80～1：110溶液，20℃30分鐘可殺死，但不能殺死芽胞和抵抗力強的病毒。添加肥皂可皂化脂肪，溶解蛋白質，促進其滲透，加強消毒效果，但毒性較大，對皮膚有刺激性，有異味，不能用於皮膚消毒。來蘇（煤酚皂）（來蘇）：47.5%甲酚和鉀配成的皂。紅棕色，易溶於水，具有去汙作用，殺菌力比煤酚強 2 至 5 倍。常用為 2%至 5%的水溶液，可用於噴灑、擦拭、浸泡容器和洗手。可在 10-15 分鐘內殺死繁殖的細菌，對生殖細胞效果較差。六氯苯酚（hexachlorophane）：雙酚化合物，微溶於水，溶於醇、酯、醚，加堿或肥皂可促進溶解，毒性和刺激性較小，但殺菌力強。主要用於皮膚消毒。以2.5～3%的六氯酚皂洗手可減少皮膚細菌80～90%，有神經系統損害的報道，故有宜長期使用的說法。
（2）酸類
對細菌繁殖體和芽胞有殺滅作用。但易損壞物品，故壹般不用於室內消毒。5%鹽酸可消毒洗滌用具、水果，加15%食鹽的2.5%溶液可消毒毛皮和皮革，10l/kg加熱30℃浸泡40小時。乳酸常用於空氣消毒，100m3空間用10g乳酸熏蒸30分鐘，可殺滅葡萄球菌和流感病毒。
（3）乙醇乙醇（酒精）
75%濃度能迅速殺滅細菌繁殖型，對壹般病毒作用較慢，對肝炎病毒作用不肯定，對真菌孢子有壹定殺滅作用，對芽胞無作用。用於皮膚消毒和體溫計浸泡消毒。因其不能殺滅病菌細胞，所以不能用於手術器械浸泡消毒。異丙醇（isopropylalcohol）對細菌的殺滅能力大於2。 可溶性蛋白消毒劑
主要為堿性藥物，常用氫氧化鈉、生石灰等。
（1）氧化氯鈉
白色結晶，易溶於水，殺菌力強，2～4%溶液可殺滅病毒和細菌繁殖體，10%溶液可殺滅結核桿菌，30%溶液可在10分鐘內殺滅芽胞，因腐蝕性強，很少使用，僅用於消滅炭疽芽胞。
（2）生石灰
水能產生高溫，溶解蛋白質，殺滅病原體。常用10～20%的石灰乳消毒排泄物，用量必須是排泄物的2倍，攪拌作用4～5小時。20%的石灰乳用於炭疽汙染場所的消毒，每隔4～6小時噴灑1次，連續噴灑2～3次。刷墻 2 次即可殺死結核桿菌。由於性質不穩定，所以塗藥時要現配現用。
3、氧化性蛋白消毒劑
包括含氯消毒劑和過氧化物消毒劑。因其消毒力強，目前在醫療防疫工作中應用最為廣泛。
（1）漂白粉
應用最廣。主要成分是次氯酸鈣[Ca(OCl)2]，含有效成分25%-30%，不穩定，能被光、熱、水分和CO2分解。它能被光、熱、濕度和 CO2 分解。因此，應將其置於密閉容器中，置於陰暗幹燥處，保存期不超過 1 年。有效成分次氯酸能滲入細胞，氧化細胞酶的硫氫因子，破壞細胞質代謝。在酸性環境中殺菌力強而迅速，高濃度可殺死芽胞，用於糞便、痰液、膿液等的粉末消毒。每升加幹粉 200 克，拌勻，放置 1～2 片，每升尿幹粉 5 克，放置 10 分鐘即可。10%～20%乳劑除對糞便和分泌物消毒外，還可用來噴灑廁所、被汙染的車輛等。如長期存放，應測定實際有效氯含量，以校正配制用量。漂白粉和片劑的有效氯含量可達 60～70%，使用時可適當降低比例。
（2）氯胺-T
有機氯消毒劑，含有效氯24～26%，性較穩定，密閉保存1年，有效氯僅損失0.1%。微溶於水（12%），刺激性和腐蝕性小，次氯酸作用緩慢。0.2% 1 小時可殺死細菌繁殖，5% 2 小時可殺死結核桿菌，殺死生殖細胞需 10 小時以上。各種銨鹽可促進其殺菌作用。1～2.5% 溶液對肝炎病毒也有作用。活性液必須在使用前 1～2 小時配制，時間過長，殺菌效果降低。
（3）二氯異氰尿酸鈉
又名優氯凈，是壹種廣泛使用的有機氯消毒劑，含氯60～64.5%。它具有高效、廣譜、穩定、高溶解度和低毒等優點。水溶液可用於噴灑、浸泡、搓揉發泡，也可直接用幹粉消毒汙染物，處理糞便等排泄物時，使用的漂白劑也壹樣。直接噴灑在地面上，劑量為10-20g/m2，與多聚甲醛幹粉混合後點燃，可將氣體熏蒸消毒，可與92號混凝劑（以羥基氯化鋁為基質，鐵粉、硫酸、雙氧水等合成）以1:4混合成為 "清水"，用於飲用水消毒。可用於飲用水消毒，也可與硫酸鈉配制成各種消毒洗滌液，如聚酯凈美、優氯凈等。對肝炎病毒有殺滅作用。對肝炎病毒有殺滅作用。此外，還有氯化磷酸三鈉、氯溴二脲酸等效果相同。
（4）過氧乙酸
又名過氧乙酸，無色透明液體，有揮發性和刺激性酸味，是壹種同效速效消毒劑，易溶於水和乙醇等有機溶劑、具有漂白和腐蝕作用，有揮發性和刺激性酸味，是壹種高效速效消毒劑，易溶於水和乙醇等有機溶劑，具有漂白和腐蝕作用，性狀不穩定。易被熱、有機物、重金屬離子、強堿等分解。0.01～0.5%時，0.5～10分鐘可殺死細菌繁殖體，1%時5分鐘可殺死芽胞，常用濃度為0.5～2%，可采用浸泡、噴灑、擦拭等方法消毒，在密閉條件下可采用氣溶膠（5%濃度，2.5毫升/平方米）和熏蒸（0.75～1.0克/立方米）消毒。
（5）過氧化氯
3～6%溶液，10分鐘即可消毒。10～25%為60分鐘，可消毒，用於耐熱塑料制品、餐具、衣物等消毒。10%雙氧水氣體深層凝膠噴霧消毒室內汙染表面；180～200毫升/立方米，30分鐘可殺滅細菌繁殖；400毫升/立方米，60分鐘可殺滅芽胞
乙醇，經肺吸收可導致麻醉，但對皮膚無損傷，可代替乙醇應用。
（6）高錳酸鉀
1-5%濃度浸泡15分鐘，可殺死細菌繁殖體，常用於食具、瓜果消毒。
4.陽離子表面活性劑
主要是季銨鹽類，高濃度凝固蛋白質，低濃度抑制細菌代謝。有殺菌濃度高、毒性和刺激性小、無漂白和腐蝕作用、無臭、穩定、易溶於水等特點。但殺菌力不強，特別是對芽胞效果不好，受有機物影響大，禁忌癥多為其缺點。國內生產的新潔爾滅、消毒寧（杜米蒼）和消毒凈對消毒寧的殺菌力較強，常用濃度為0.5～1.0‰，可用於皮膚、金屬器具、餐具等的消毒。不適用於排泄物、分泌物消毒。
5.烷基化消毒劑
（1）福爾馬林
34 ～ 40% 的甲醛溶液，有較強的殺菌作用。1～3%溶液可殺滅繁殖型細菌，5%溶液90分鐘或可殺滅芽胞，室內熏蒸消毒壹般用20ml/m3加等量水10小時，消除汙染的芽胞，則需80ml/m324小時。m324小時，適用於皮毛、人造纖維、絲織品等耐熱物品。因其滲透性差，刺激性大，所以消毒物品應分散放置，屋內必須封閉。
（2）戊二醛
作用同甲醛。在酸性溶液中較穩定，但殺菌效果差，在堿性溶液中可維持2周，但強提高殺菌效果，所以通常用2%戊二醛加0.3%碳酸氫鈉，校正pH值為化合物（殺菌效果增強，穩定性可維持18個月。具有無腐蝕性、廣譜、速效、高熱、低毒等優點，可廣泛用於殺滅細菌、芽胞和病毒的消毒。不宜用作皮膚、粘膜消毒。
（3）環氧乙烷
低溫下為無色液體，沸點10.8℃，故常溫下為氣體滅菌器。其作用是通過烷基化破壞微生物蛋白質的趨化性。壹般應用是在 15 ℃ 下 0.4 ～ 0.7kg / m2，持續 12 ～ 48 小時。溫度提高 10℃，殺菌力可提高 1 倍以上，相對濕度 30%殺菌效果最佳。具有活性高、穿透力強、不損傷物品、無殘留毒物等優點。可用於紙張、書籍、布匹、毛皮、塑料、人造纖維和金屬制品的殺菌消毒。由於穿透力強，需在密閉容器中滅菌。避免明火，以防爆炸。消毒後要通風，防止吸入。
6.其他
（1）碘
通過鹵化作用幹擾蛋白質代謝。其作用迅速而持久，無毒，受有機物影響小。常為硫酒、硫伏（硫和表面活性劑為不定共軛物）。常用於皮膚和粘膜消毒、醫療器械應急處理。
（2）洗必泰
為亞硫酸氫鹽化合物。對細菌有較強的消毒作用。可用於手、皮膚、醫療器械、衣物等的消毒，常用濃度為 0.2～1‰。