隨著生物醫藥產品外包的逐漸興起，生物醫藥市場開始蓬勃發展。然而，生物醫藥是典型的 "高投入、高風險、高產出、長周期 "產業，這些特點導致了生物醫藥企業發展的不均衡。由於生物技術產品研發成本巨大、周期長，融資渠道不暢的國內中小企業面臨困境。
據了解，在美國資本市場，中國生物醫藥企業除了以IPO形式上市外，還有反向兼並、合資、外包等多種融資形式。"那些缺乏資金的生物醫藥中小企業，很可能在產品無法實現盈利之前就被市場淘汰"。.
我國生物醫藥的原創研究和資本市場遠遠落後於國外，這導致我國生物醫藥產業陷入低水平重復生產和惡性競爭的局面。
對於中國生物制藥企業來說，"創新 "是企業發展的靈魂。專家指出，鼓勵自主創新，重點是將我國具有自主知識產權的產品產業化，提高產業自主創新能力；著力解決影響產業發展的重大問題，加快培育我國技術基礎和優勢產業領域，形成產業突破。
此外，建立良好的高科技投資市場、生物風險投資基金和獨立評估機構是生物醫藥產業最重要的資本基礎。以企業為主導的資本流動是中國生物醫藥產業發展的根本出路。以發展原創技術為核心競爭力的生物醫藥研發企業，更需要具有戰略眼光的投資者和政府的支持，這是中國生物醫藥產業發展最迫切的問題。
我國生物醫藥投資應形成以企業為主體的結構，資金流向以企業為目標，吸引具有專業知識背景的管理者，聚集壹大批具有不同專長的科學家，在壹定專利技術的基礎上橫向擴散。產業化的成果是眾多科學家集體智慧的結晶，要求企業的領導者是具有知識資本的管理人才。國家明確提出了以企業為主體發展創新型科技的思路，讓資本朝著正確的方向流動，但改變需要時間。而民間資本還停留在原有的觀念上，仍以高校科學家為中心，試圖以他們為招牌，吸引更多的資金。
雖然生物醫藥產業尚未實現盈利，但資本仍在不斷湧入，尋找機會。對於許多風險投資基金來說，生物醫藥已成為熱門投資領域，只有那些具有創新能力的公司才能受到關註。