兔常用消毒藥有燒堿（氫氧化鈉）、草木灰水、石灰乳、來蘇兒、漂白粉、新潔爾滅、福爾馬林、過氧乙酸、菌毒敵、百毒殺、消毒靈和酒精、碘酒、高錳酸鉀等。
（1）燒堿（氫氧化鈉）
對細菌、病毒，甚至寄生蟲卵，均有強大的殺滅作用。含94%氫氧化鈉的粗制品，殺菌作用強。2%～4%的低濃度，對壹般細菌和病毒易殺滅；20%高濃度的氫氧化鈉對芽胞桿菌、部分蟲卵有殺滅作用。壹般籠舍和籠底板、產仔箱等設備的消毒宜用低濃度。為控制疫情的強制性消毒，對墻、地面、耐堿的籠具和運輸器具采用高濃度為宜。燒堿液的配制，若用溫水可顯著增強其殺菌力。凡采用燒堿水消毒，事先應清除汙物，消毒後，必須用水沖掉堿水。
（2）草木灰水浸液
草木灰內含有氫氧化鉀、碳酸鉀。在50千克水中加入15千克新鮮草木灰煮沸1小時，經過濾後噴灑兔舍和地面，可代替燒堿的作用。但須現配現用。
（3）生石灰（氧化鈣）
灰白色、塊狀，加水生成氫氧化鈣，有良好的殺菌作用。壹般用10%～20%石灰乳，塗刷兔舍的五面板壁、地面，或直接用生石灰粉撒於糞池、汙水周期、陰濕地面。用石灰乳要現配現用，因它能吸收空氣中的二氧化碳變成碳酸鈣而失效。
（4）來蘇兒（煤酚皂）溶液
含50%煤酚，紅棕色濃稠液體，易溶於水和酒精。能使菌體蛋白變性、沈澱，而具殺菌能力。主要用於洗手、器械和噴灑場地、籠舍消毒。起防腐、止酵的作用。壹般用2%～3%濃度。
（5）漂白粉（含氯石灰）
灰白色粉末，有氯臭味，微溶於水，含有效氯25%～30%（低於16%不用）。久存易分解失效，須置密閉幹燥處保存。殺菌作用快而強，還有除臭作用，對芽胞有殺滅作用。常用濃度5%～20%，主要用於籠舍、排泄物的消毒。不宜用於有色紡織物和金屬用具。
（6）新潔爾滅（溴化芐烷銨）
對革蘭氏陽性細菌和陰性細菌有殺滅作用。但對病毒、芽胞、結核桿菌、綠膿桿菌沒有殺滅作用。易溶於水，性質穩定，對皮膚、黏膜等組織刺激性小，穿透力強，並有脫脂，去汙功效。常用於家兔皮膚消毒（0.1%），黏膜消毒（0.01%～0.05%），器械、器皿消毒（0.1%，30分鐘）。若用於金屬器械消毒需加0.5%亞硝酸鈉防腐。禁止與肥皂、碘劑、鹽類、堿、高錳酸鉀等配用，以免失效。
（7）福爾馬林（甲醛）
市銷產品壹般含40%的甲醛。主要用於家兔籠舍熏蒸消毒。每立方米空間用20毫升福爾馬林加等量水，加熱密閉熏蒸10小時。用5%～10%的福爾馬林溶液，可作糞尿溝等環境的消毒。使用時須註意：熏蒸前應將兔子和飼料轉移，消毒完須先打開門窗通風換氣，無藥味後方可轉回兔子和飼料。
（8）過氧乙酸
是壹種高效殺菌劑，無色透明的液體，市售品濃度多為20%，密閉避光保存於塑料瓶中。以用0.1%～0.5%的溶液噴灑兔舍地面、走道、墻壁、門窗、兔籠、車輛等。3%～5%溶液常用來加熱熏蒸，做環境消毒。
過氧乙酸不穩定，壹般有效期為半年。消毒時宜現配現用。另外應對消毒人員的眼睛、呼吸道加以保護，兔子也應轉移。
（9）菌毒敵（復合酚）
是壹種廣譜、高效、低毒對人畜無腐蝕性的新殺菌藥。壹般商用菌毒敵為0.5%的水溶液。主要用於籠舍及附屬設備和用具的消毒。
（10）百毒殺
是高效、廣譜殺菌劑。市售產品為0.02%的水溶液。主要用於籠舍、用具和環境消毒。使用時詳見產品說明書。
（11）消毒靈
本品對人畜無害，無刺激和腐蝕性，易於貯運，使用方便。對細菌和病毒有高效殺滅作用。可廣泛用於家兔體表、圈舍、飼槽和運輸器具的消毒。
（12）酒精（乙醇）
無色易燃，易揮發的液體。酒精能使蛋白質變性，從而具有較強的抑菌和殺菌作用，是壹種最常用的皮膚消毒藥。能殺死壹般細菌，對芽胞菌無效。有蛋白質存在時，殺菌力減弱，95%濃度的滲透力反而比70%～75%濃度的滲透力低，消毒效果較差。但可用於酒精燈作火焰消毒。70%～75%的酒精是給兔子打針時作皮膚消毒和註射針頭及體溫表最常用的消毒藥，養兔場必備。
怎樣把95%的酒精配成家兔消毒用的70%～75%的酒精溶液呢？舉例如下：
欲配70%酒精100毫升，應取95%酒清多少毫升？
70%×100＝95%×m>（95%酒精毫升數）
即取95%酒精73.7毫升加水至100毫升即可。
（13）碘酒（碘酊）
為最常用的皮膚消毒藥之壹。能氧化病原體原漿蛋白的活性基團，並與蛋白質的氨基結合而使其變性，有強大的殺滅病原體（細菌、病毒、芽胞、真菌、原蟲）的作用，並具有壹定的止血作用。兔用碘酊壹般為2%，可取碘化鉀1克溶於少量蒸餾水中，再加碘片2克與適量的70%～75%酒精，攪拌使其溶解，再加70%～75%酒精至100毫升即得。
（14）高錳酸鉀（錳強灰）
深紫色結晶，易溶於水，無臭。是壹種強氧化劑，久置還原為棕色而失效，故須新鮮配制，有殺菌、除臭作用。常用於沖洗黏膜腔道、創傷和化膿腔洗滌，作用比過氧化氫持久。