配制溶液最好用涼開水，因為高錳酸鉀化學性質不穩定，水溫過高會使其分解失效。配制好的水溶液壹般只能保存2小時左右，當溶液變成棕紫色時，就會失去消毒作用，所以最好現配現用，而且要背光使用，在室外需在上午9點前或傍晚進行，陰天改在中午進行。
2.適量用藥，安全使用
使用濃度不僅與魚的種類、規格大小、體質狀況、病情輕重、藥浴密度等因素有關，還與水體的環境條件密切相關，如高錳酸鉀在有機質含量較高的水體中就應適當增加其用量。海水條件下高錳酸鉀的氧化能力較強，可適當降低海水中的藥物濃度。用量不宜超過安全濃度範圍，也不宜長期使用，以防損傷水生動物的鰓組織，造成急性中毒。壹般浴池濃度為 10 毫克/升～20 毫克/升，時間為 15 分鐘～30 分鐘；全池濃度為 4 毫克/升～7 毫克/升。
3.合理混合，高效使用
為增強殺菌效果，高錳酸鉀可與其他藥物混合使用，如用甲醛熏蒸消毒，也可將高錳酸鉀與1.1%鹽酸溶液混合使用，混合前需將藥物溶解或稀釋。但用時要註意物理或化學禁忌，高錳酸鉀與有機物如甘油、酒精、鞣酸等混合會發生還原、脫色失效，與氨水及其制劑混合呈絮狀沈澱失效，與甘油、藥用木炭、鞣酸混合研磨時會發生爆炸。
4.快速清除高錳酸鉀殘渣
如果用魚缸給魚消毒，消毒完成後，需立即清除高錳酸鉀殘渣。如果用換水的方法，就來不及了。恰好，維生素 C 可以幫助我們。維生素 C 是壹種還原劑，用在人體內，可以起到抗氧化抗衰老的作用，使用維生素 C 註射液或維生素 C 片劑溶液可以快速清除高錳酸鉀殘留物。