1：逐步取消醫院藥品加價
新醫改方案著力緩解老百姓“看病貴看病難”
新方案指出，醫療機構要實行“醫藥分家”，通過實行藥品購銷差別加價、設立藥事服務費等方式逐步改革或取消藥品加成政策，同時采取適當調整醫療服務價格、增加政府投入、改革支付方式等措施完善公立醫院補償機制。這壹規定被專家視為方案的“興奮點”，是降低藥費的壹種努力，是老百姓最為關心的話題，但對現行醫療體制的沖擊也是最大。
2：建立國家基本藥物制度
新方案規定，建立國家基本藥物制度。中央政府統壹制定和發布國家基本藥物目錄。基本藥物由國家實行招標定點生產或集中采購，直接配送，在合理確定生產環節利潤水平的基礎上統壹制定零售價。城市社區衛生服務中心、鄉鎮衛生院、村衛生室等基層醫療衛生機構應全部使用基本藥物，其他各類醫療機構也要將基本藥物作為首選藥物並確定使用比例。
3：明確政府衛生投入增幅
公益性確定公立醫院改革航向標
新方案明確提出要強化政府責任和投入。逐步提高政府衛生投入占衛生總費用的比重，使居民個人基本醫療衛生費用負擔明顯減輕;政府衛生投入增長幅度要高於經常性財政支出的增長幅度，使政府衛生投入占經常性財政支出的比重逐步提高。
4：將引導壹般診療下沈到基層
新方案對大力發展社區衛生和農村衛生等基層醫療衛生服務提出了很多設想，同時強調要“引導壹般診療下沈到基層”。而引導的方法主要通過“改善服務能力、降低收費標準、提高報銷比例等綜合措施”來實現。
5：多元投入機制實現服務分流
方案提出建立政府主導的多元衛生投入機制，鼓勵和引導社會資本發展醫療衛生事業。積極促進非公醫療衛生機構發展，形成投資主體多元化、投資方式多樣化的辦醫體制。
“滿足全民基本醫保的前提下，還是會有部分人群產生‘高端需求’。”曾益新院士指出，比如有人生孩子希望有獨立的房間等。而對於過去發展頻頻遭遇“政策瓶頸”的民營醫院來說，這壹規定是“松綁”的利好消息。
6：非營利醫院實行政府指導價
在規範醫療服務價格管理上，對非營利性醫療機構提供的基本醫療服務，實行政府指導價，其余由醫療機構自主定價。不同級別的醫療機構和醫生提供的服務，實行分級定價。規範公立醫療機構收費項目和標準，研究探索按病種等收費方式改革。建立醫用檢查治療設備儀器價格監測、服務成本監審和服務價格定期調整制度。