協助局領導處理機關日常政務；組織起草有關重要文稿；負責有關重要會議的組織；負責領導批示和會議決定等重要事項的督辦工作；負責信息、文秘、檔案、保密、信訪、接待聯絡工作；負責議案、建議、提案工作；負責行政、後勤、保衛及財務和各類規費、經費的管理；承辦機關和直屬單位人員出國(境)的有關工作。
辦公室電話：(86)010-83979401, 83979406 傳真：(86)010-83560780
E-mail：bangongshi@bjda.gov.cn
局值班室電話：(86)010-83979400(18:00-8:00)
器械處
負責對醫療器械、衛生材料、醫用生物材料、體外診斷試劑產品質量及生產、經營、使用實施監督；負責醫療器械、體外診斷試劑、醫用生物材料、衛生材料產品的法定標準和產品分類管理的監督實施；負責對醫療器械生產、經營企業的審批；核發醫用生物材料、衛生材料生產、經營企業許可證；負責對企業和醫療機構生產的醫療器械產品的註冊；負責二類醫療器械產品臨床試驗的審批；負責初審、推薦醫療器械臨床試驗基地；負責醫療器械產品不良反應再評估；負責推行醫療器械質量體系認證和產品安全認證工作；負責檢查、抽驗生產、流通、使用單位的產品質量，發布產品質量公告；審批醫療器械廣告。
電話：(86)010-83979525
傳真：(86)010-83560730
註冊處
負責國家和地方有關藥品法定標準的監督實施；初審新藥、仿制藥品、中藥保護品種以及新藥臨床試驗；審查出口藥品；擬定、修訂藥品地方標準、中藥飲片炮制和醫療單位制劑規範；負責藥品再評價和淘汰藥品的初審工作；依法監管麻醉藥品、精神藥品、毒性藥品、放射性藥品及特種藥械。
電話：010-83979465 傳真：010-83560723
E-mail：zhucechu@bjda.gov.cn
市場處
貫徹實施藥品流通法律法規，監督實施處方藥、非處方藥、中藥材、中藥飲片的購銷規則；監督實施藥品經營質量管理規範；負責藥品批發經營企業資格的初審；實施藥品批發、零售企業資格認定制度；核發藥品零售經營企業許可證；監督檢查、抽驗生產、經營、使用單位的藥品質量，發布全市藥品質量公報；監管中藥材集貿市場；審批藥品廣告。
電話：010-83979515 傳真：010-83979518
E-mail：shichangchu@bjda.gov.cn
安監處
負責初審、推薦國家基本藥物目錄和非處方藥物目錄；組織實施非處方藥制度；初審臨床藥理基地；負責組織藥品不良反映監測；監督實施藥物非臨床研究、臨床試驗、藥品生產、醫療單位藥品質量管理規範；核發藥品生產企業、醫療單位制劑許可證；依法監管麻醉藥品、精神藥品、毒性藥品、戒毒藥品和放射性藥品的生產、經營和使用；核發醫藥包裝材料（含容器）生產、經營企業許可證。
電話：010-83979503 傳真：010-83560728
E-mail：anjianchu@bjda.gov.cn
人事處
負責機關、直屬單位幹部隊伍建設規劃及部署的落實工作；按照幹部管理權限負責機關工作人員的考核、任免、調配、獎懲、培訓、工資福利、退休等工作；指導直屬單位人事管理工作；負責機關、直屬單位機構編制管理工作；負責機關和直屬單位專業技術職務評定工作；負責實施執業藥師(含執業中藥師)資格認定制度，組織執業藥師(含執業中藥師)資格考試、註冊工作。
電話：010-83979481 傳真：010-83560726
E-mail：renshichu@bjda.gov.cn
法規處
組織起草有關藥品監督管理方面的地方性法規、規章草案；對本部門制定的規範性文件進行合法性審核；負責有關文件的匯編工作；負責行政執法監督和執法監管人員的培訓工作；核發藥品執法人員的執法證件；調查研究有關法律、法規、規章的執行情況；承辦行政復議和行政訴訟應訴工作。
電話：010-83979473 傳真：010-83560725
E-mail：faguichu@bjda.gov.cn
監察處
1、監督檢查駐在部門及所屬系統貫徹執行黨的路線方針政策，遵守國家法律、法規，執行市委、市政府決定、命令的情況。
2、對駐在黨組和行政領導班子及其成員維護黨的政治紀律，貫徹執行民主集中制，選拔任用領導幹部，貫徹落實黨風廉政建設責任制和廉政勤政的情況進行監督，每半年向市紀委、市監察局報告壹次，發現重大問題及時報告。
3、經批準，初步核實對駐在部門黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的舉報；參與調查駐在部門黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的案件；負責調查駐在部門及所屬系統處級幹部違反黨紀政紀的案件及其他重要案件。
4、協助駐在部門黨組和行政領導班子組織協調駐在部門及所屬系統的黨風廉政建設和反腐敗工作。
5、受理對駐在部門黨組織、黨員和行政監察對象的檢舉、控告，受理駐在部門黨員和行政監察對象不服處分的申訴。
6、承辦市紀委、市監察局交辦的事項。
電話：010-83979442
E-mail：jianchachu@bjda.gov.cn
稽查處
根據有關藥品方面的法律、法規，負責對藥品研究、生產、流通和使用中違法、違規行為及其負責人的稽查工作；依法查處制、售假劣藥品的行為人和責任人；受理有關藥品方面違法、違規案件的舉報查處工作。
電話：010-83979550
E-mail：jichachu@bjda.gov.cn
財務處
負責局機關及所屬單位的財務預算、決算管理及資金撥付工作；監督檢查本系統財務預算、財務紀律和各種財務管理制度的落實情況；負責本機關固定資產的管理工作。
電話：(86)010-83979497
受理辦
負責市局行政許可事項的受理，按照許可項目的程序性規定，負責統壹接辦行政許可事項；對申請人提出的許可事項，依據行政許可法的有關規定做出受理或不予受理的決定；負責行政許可決定的送達；負責行政許可事項的收費；負責行政許可事項在辦公場所的公示。
電話：(86)010-83979426（27）
宣傳處
研究制訂本系統科學技術發展規劃和工作計劃，並組織實施；組織協調本系統科研開發、新技術推廣、科技成果評審、學術交流等工作；負責本市藥品監督行業的宣傳工作；負責組織、指導本系統幹部理論學習、職工思想教育和精神文明建設工作。
電話：(86)010-83979435
保化處
研究擬訂保健食品、化妝品安全方面的工作規劃、政策措施，並組織實施；負責保健食品、化妝品安全的監督管理，收集、匯總、分析相關信息，並定期向社會發布；負責保健食品、化妝品的監督執法，依法組織調查處理保健食品、化妝品安全事故，組織、協調保健食品、化妝品安全事故的應急救援工作；負責保健食品、化妝品產品的審查以及生產經營單位的資質管理工作。
電話：(86)010-83979455
局機關黨委
宣傳和執行黨的路線、方針、政策，宣傳和執行黨中央、上級組織和本級組織的決議；組織黨員認真學習馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論、“三個代表”重要思想；學習科學文化和業務知識；對黨員進行嚴格管理，督促黨員履行義務，保證黨員的權利不受侵犯；對黨員進行監督，嚴格執行黨的紀律，加強黨風廉政建設，堅決同腐敗現象作鬥爭；做好機關工作人員的思想政治工作，推進機關社會主義精神文明、政治文明建設，了解、反映群眾的意見，維護群眾的正當權益，幫助群眾解決實際困難；對入黨積極分子進行教育、培養和考察，做好發展黨員工作；協助黨組管理機關黨組織和群眾組織的幹部；配合幹部人事部門對機關行政幹部進行考核和民主評議；對機關行政幹部的任免、調動和獎勵提出意見和建議；領導機關工會、***青團、婦聯等群眾組織，支持這些組織依照各自的章程獨立負責地開展工作；按照黨組織的隸屬管理、領導直屬單位黨的工作。
電話：(86)010-83979441
辦公室咨詢電話(Tel):(010)83979401 傳真(Fax):(010)83560780