1.對人體免疫系統的影響:如果過量攝入益生菌，免疫系統會過度興奮，從而引起過敏或自身免疫性疾病。
2.濫用益生菌會減少正常菌群的數量，以至於腸道會讓有害細菌滋生。
3.敏感人群慎用:脾虛胃弱、早期感冒、免疫缺陷、糖尿病等相關疾病患者慎用益生菌。
4.疏忽儲存:益生菌不宜暴露在高溫潮濕的環境中，否則會導致細菌死亡，進而產生異味。
5.益生菌配伍錯誤:有些益生菌產品含有不同的菌種，不同菌種的混合會影響益生菌的功效。
6.其他疾病:益生菌可以幫助緩解許多消化道相關疾病，但不能治愈其他疾病(如關節炎、心臟病等。).
7.工業益生菌的定制過程中會留下很多有害物質。
8.缺乏維生素:長期服用益生菌藥物會使體內生長的益生菌占據過多的腸道空間，從而降低食物中微量元素的吸收。
9.營養不均衡:過量或長期使用益生菌可能導致體內含氮化合物和氮代謝物過量，從而造成營養不均衡的風險。
10.隨意購買:市面上有很多低價低質的益生菌產品，產品質量難以保證，攝入後可能會造成壹定的危害。
女性服用益生菌的好處雖然益生菌有很多危害，但是對於女性來說，適量攝入益生菌會帶來很多好處。
1.改善便秘:因為女性壹般生理結構比男性弱，生理功能更復雜。如果受到月經相關問題的困擾(如生理障礙等。)，很容易導致便秘。益生菌可以改善腸道環境，降低便秘的風險。
2.降低陰道感染的風險:子宮肥大癥和女性便秘常引起盆腔炎等疾病。益生菌有助於維持陰道內的酸堿度，增加陰道內有益菌的比例，從而降低感染的風險。
3.利用益生菌抑制體內惡性繁殖，保障母嬰健康成長。從腸道開始，幫助寶寶降低尿路感染的風險。
4.益生菌有助於調節情緒問題。研究證實，長期使用益生菌可以降低抑郁傾向、焦慮等負面情緒，增強機體免疫功能，保持愉快的心情。
5.控制水腫癥狀。女性經期容易水腫，合理攝入益生菌也有助於控制水腫。
6.改善腸胃不適。女性容易因為不良生活習慣、飲食不規律、壓力大而出現腸胃不適，而益生菌可以調節腸道菌群，從而改善腸胃不適。
總之，在服用益生菌之前，妳需要了解這種益生菌是否適合妳的身體狀況和健康問題。如有適應不良史，應謹慎選擇合適的益生菌產品，咨詢專業醫生，並在專業醫生指導下適量攝入。