防治小麥銹病可以使用三唑酮、烯唑醇、丙環唑。
1、三唑酮
在為小麥防治銹病的時候，目前使用最多的藥劑就是三唑酮。在小麥銹病的發病初期合理的噴施三唑酮，並均勻的噴灑效果會更好。
2、烯唑醇
烯唑醇也可以防止小麥銹病，我們可以在它的發病初期為它噴施12.5％的烯唑醇2000倍液。在種植過程中應該合理地為它噴施，註意不要漏施，如果防治效果不好的話，應該及時為它噴施第二次。
3、丙環唑
丙環唑是壹種保護和治療兼具的殺菌劑，可以被根，莖，葉等部分吸收。對於預防小麥銹病也有很好的效果。
小麥銹病農業防治方法
1、播種地塊選擇及整地
選擇地勢平坦、坡小、冬季積雪穩定、麥苗能安全越冬的地塊，土壤肥力中上等，灌、排水良好，土層深厚的壤土或砂壤土，前作為水稻、油菜、豆類、綠肥等。根據測土配方，在翻地前每畝施有機肥1500-2000千克，均勻撒到地裏，立即耕翻，耕翻深度達到25厘米以上。
適墑期內用輕型耕機或用畜力耙細保墑、整平地塊，整地質量達到“齊、平、松、碎、凈、墑”六字標準，做到土壤細碎，無漏耙現象，為播種創造良好的條件。
2、選用抗病品種
選擇具有抗性的小麥良種，如雲麥2號、3號、39號、55號、56號；臨麥6號、15號、16號；宜麥1號、2號等系列品種。推廣小麥良種的同時，建立小麥種子田，防止抗病品種混雜和喪失抗性，並做好品種合理布局，防止品種單壹化。
3、適期晚播
播種越早，病菌侵染的機會越多，越冬菌源量越大，發病就越早、越重。因此，在適播期內，在保墑的前提下，要適當晚播。