本條目介紹壹下全球免費讓公眾使用的化合物及藥物分子數據庫，對化學及藥物研究特別有用。
（註意：以下信息來自於美國MedKooBiosciences，Inc。）
1.美國國家醫學圖書館化學身份證（CHEMIDPLUS）數據庫
該網頁可檢索藥物化學結構，本網站可以用藥物名稱查找其化學結構.此外,本數據庫還可以查看毒性,理化性質,藥品代碼等。
2.美國國家醫學圖書館PUBCHEM數據庫可檢索藥物化學結構
本數據庫是美國國家健康研究所（NIH）和美國國家醫學圖書館（NLM)的大型藥物分子庫。NIH是美國醫學研究機構，下設27個機構和中心，也是美國健康與人類服務部的壹個組成部分。它是壹個重要的聯邦機構，執行和支持基礎、臨床及可轉化醫學研究，調查普通及罕見疾病的原因、治療及治愈情況。PubChem數據庫是美國國家衛生署分子庫路線圖計劃的壹個組成部分，是由NIH國家生物技術信心中心開發的壹個化學結構及分子生物活性綜合數據庫.
3。美國國家癌癥研究所（NCI）抗癌藥藥物詞典
該數據收集了4000多條與癌癥醫學相關的術語和化合物性質。
4.藥物合成數據庫（Drug）
該數據是這個藥物在線網推出的數據庫.本數據庫提供近7000種已上市或在研藥物的藥物合成相關的信息，如藥品名、結構式、化學名、CAS登記號、分子式、分子量、化學活性、開發階段、研究機構等。最大的優點是快速檢索合成路線，並給出參考文獻來源。
檢索條件支持模糊查詢，各輸入條件間的檢索關系為邏輯與（即AND關系）。檢索條件選擇其壹即可查詢。檢索方法包括：
*藥物名稱：（註：包含通用名、商標名、研發代號、異名等）。如Loratadine、Cefpirome.
*化學名稱：（註：包含CA命名、普通命名等）。
*CAS登記號：（註：美國化學文摘登記號）。
5.有機合成方法數據庫
Since1921,hasprovidedthechemistrycommunitywithannualcollectionsofdetailed,reliable,andcarefullycheckedproceresforthesynthesisoforganiccompounds.Someproceresdescribepracticalmethodsforofspecificcompoundsofinterest,whileotherimportantsyntheticmethodswithgeneralutility.Eachprocereiswritteninmoredetailascomparedtotypicalinotherjournals,andeachreactionandalldatahasbeencarefullycheckedforinthelaboratoryofamemberoftheBoardofEditors.
Organicmaybeaessedeitherviathetablesofcontentsof(journalmode)orbyconctingstructureand(databasemode).Specificindivialprocerescanbeaessedviathetableofcontentsforeithertheoriginalannualvolumevolumeinwhichtheprocereappeared.DatabasemodeallowsuserstosearchallvolumesofOrganicSynthesesbykeywordsorbyinputtingstructuresand.StructuretheChemDrawpluginwhichcanbedownloadedaordingtofoundintheleftmargin.ArticlesfromfuturevolumesofOrganicSynthesesthatarenotyetincorporatedinthesearchabledatabasecanbeaessedontheOrgSynExpresspage.
6.有機合成人名反應
該數據庫是藥物在線網推出的數據庫.TheOrganicNameReactions(ONR)sectionisintendedtoservetheprofessionalchemistandstudentbydescribingorganicchemicalreactionswhichhavecometoberecognizedandreferredtobynamewithinthechemistrycommunity.Aselectgrouphasbeenchosenforadditiontothissection.Eachreactiondescriptionisdesignedtobeinformativeandrepresentativeofthepertinentliterature;however,itisnotmeanttobecomprehensive.Thedescriptionsarecomposedofthefollowing:(1)name(s)associatedwiththereaction,(2)theoriginaland/orprimarycontributor(s)connectedwiththediscoveryand/ordevelopmentofthereaction,(3)aconcisedescriptionofthetransformation,(4)areactionscheme,(5)keyreferences,and(6)crossreferencestootherONRbasedoncommonalities.Theindexincludedinthissectionalsolistssupplementaryterms.
7.有機合成反應庫
該數據可是這個藥物在線網推出的數據庫.含有400多個有機合成人名反應。
8.化學物質索引數據庫（ChemicalIndexDatabase）
該數據庫是藥物在線網推出的數據庫。本數據庫為化學物質特性數據庫，包含大量具藥理活性及生物活性的物質性質信息數據。檢索條件支持模糊查詢，各輸入條件間的檢索關系為邏輯與（即AND關系）。化學結構式為矢量格式圖片，可利用系統自帶圖片預覽工具或支持該格式的工具進行無損縮放查看。檢索結果包括：（a)索引信息：如物質名稱、化學結構式圖、化學文摘登記號(CAS)、CA名稱、商標名、化學結構式、分子式、分子量、元素組成等。(b)參考文獻：提供公開物質理化性質、制備方法、分析方法、藥理藥效、臨床研究等的重要期刊、專利、綜述等極具參考價值的文獻。(c)物質特性：包括理化特性數據，如熔點、沸點、閃點、溶解性、多晶物質狀態、光譜吸收特征數據、藥物治療分類等.
其檢索的方法有：
*物質名稱(英文名)：（包含化學名、通用名、商標名、異名等的全名或部分(大於3個字符)，如Ceftriaxone,Adefovir.）
*CA登記號(CASRegistryNumber)：
*註:美國化學文摘登記號
*參考文獻(LiteratureReferences)
*藥理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治療分類(TherapeuticCategory)
*分子式(MolecularFormula)
*分子量(MolecularWeight)
*熔點(MeltingPoint)
*註:熔點值,以攝氏度為單位
*沸點(BoilingPoint)
*註:沸點值,以攝氏度為單位
*解離常數(pKa)
*比旋度(OpticalRotation)
*油水分配系數(LogP)
*最大吸收值(AbsorptionMaximum)
*密度(Density)
*折光率(IndexofRefraction)
*毒性數據(Toxicity)