藥物分析專業就業方向如下：
1、藥物分析專業培養具備化學、生物學和藥學的基本理論和技能，熟練掌握國內外藥品生產質量管理規範、藥品質量監督管理的法規與標準體系，能夠在藥物研究、生產、流通和臨床使用領域，從事藥物分析研究、藥物質量控制與管理、臨床用藥監測等工作的高級科學技術人才。
2、要求系統掌握藥物分析的基本理論、基本知識和基本技能，具有良好的專業素養，具備藥物分析及體內藥物分析、中藥及其制劑分析、新藥研發、藥品質量標準制定、藥事管理知識能力，能夠在藥品生產企業的質量管理。
3、質量控制關鍵質控及管理崗位，藥品研發企業的新藥研發、藥品質量標準制定、臨床研究等關鍵崗位，國家及省市地方食品藥品監督管理局、藥品檢驗檢定所藥品檢驗檢定及管理崗位，藥品流通領域質量管理崗位等方面工作。
4、本專業學生畢業後可在藥品監督管理、醫藥衛生監察等部門和藥品生產經營企業、醫藥科研院所、醫療衛生機構等單位從事藥物設計、藥品檢驗、藥品生產、質量控制、臨床藥物分析、體內藥物分析等工作。例如：運動員體內興奮劑的檢測。
5、藥物分析在醫藥化工行業中是算就業前景比較好的，特別隨著醫藥化工行業的興起在上海，北京，浙江，江蘇壹帶化工企業，很多公司需要質檢或分析員，如果在比較大的企業或科研機構，妳的分析專業能力強的話是很不錯的
6、另外我國的藥學事業近幾年的發展也是非常迅猛的，許多藥品都得到了國際市場的認可，也與外國企業建立了合作關系，但在專業人才方面有稀缺，這表明藥學專業有很廣闊的發展前景。總而言之藥物分析學專業就業前景還是很不錯的。
藥物分析的任務
1、化學藥物和生物技術藥物的定性和定量分析，藥物質量標準的制定。
2、藥物分析中的新技術和新方法，及其在藥學和生物醫學中的 應用。
3、體內藥物分析。
4、中藥分析和新藥開發研究。