如何科學合理的在水產養殖中使用藥物，專家建議從以下幾點入手。
壹、註意用藥的及時性和準確性。首先要對池塘的生態條件、水質情況、魚體狀況和藥物的作用，有充分的了解，然後進行綜合分析，得出正確的治療方案和用藥方法，避免亂用魚藥，切不能身邊有什麽藥，就用什麽藥，圖省事方便。對於已發病的池塘，弄清原因後，應及時用藥，切莫拖延時間。只有在早期病魚雖食欲下降，但還能攝食藥餌的情況下，藥物才會發揮治療作用，再加上外用藥物對池塘的消毒作用，疾病才能被控制。
二、在綜合治療時註意藥物的拮抗性和協助性。水產養殖中，絕大多數的外用藥多少都會受到水質影響。在多種藥物綜合治療時，互相之間影響尤為明顯。如常用的生石灰，它不僅與硫酸銅、漂白粉和富氯有拮抗作用，而且也受水中磷或氨氮的影響，同樣磷或氨氮也受生石灰作用而影響肥效，因此在生產使用時應錯開5-7天左右時間。
三、註意用藥的可靠性和安全性。目前水產藥物的生產管理還不完善，對所生產的水產藥物在檢測可靠性手段方面也不先進，然而水產新藥品種遞增速度卻很驚人。對諸多的新藥，用戶使用前，如條件允許，先做壹下藥物試驗是很必要的，通過試驗，就可防止劣質藥物直接用於生產所造成的危害。對那些劑量要求很嚴格的藥物，如漂白粉，在生產使用時，只要誤差百萬分之壹的濃度，就可引起死魚現象，應引起足夠的重視。