乙肝帶毒者不是抗病毒治療的適應癥，壹般都不應當使用抗HBV藥物。但是，當本人強烈要求進行治療時，就壹定要做肝穿刺檢查，如能證明肝臟確確實實存在炎癥改變，又符合慢性乙肝的病理學診斷標準，或通過肝穿刺證明是早期肝硬化，同時血清學檢測HBv標誌物證明有病毒的復制，這才可以給予抗病毒治療。
抗病毒治療乙肝壹般適應證包括：
①HBeAg陽性者，HBV-DNA≧100，000 (1E5，10的5次方)拷貝/ml（相當於20000IU/ml）；HBeAg陰性者，HBV-DNA≧10000 （1e4， 10的4次方）拷貝/ml（相當於2000IU/ml）；
②ALT≧2×ULN；如用IFN治療乙肝，ALT應≦10×ULN，血清總膽紅素應﹤2×ULN；
③ALT﹤2×ULN，但肝組織學顯示KnodellHAI≧4，或炎性壞死≧G2，或纖維化≧S2。
對持續HBV-DNA陽性、達不到上述治療標準，但有以下情形之壹者，亦應考慮應用抗病毒治療來有效的治療乙肝：
①對ALT大於ULN且年齡﹥40歲者，也應考慮抗病毒治療乙肝；
②對ALT持續正常但年齡較大者（﹥40歲），應密切隨訪，最好進行肝組織活檢；如果肝組織學顯示KnodellHAI≧4，或炎性壞死≧G2，或纖維化≧S2，應積極給予乙肝抗病毒治療；
③動態觀察發現有疾病進展的證據（如脾臟增大）者，建議行肝組織學檢查，必要時應對乙肝給予抗病毒治療。 壹是HBv復制活躍，HBeAg陽性、HBv DNA陽性；
二是肝臟組織有炎癥改變。
對第壹條，乙肝帶毒者都可掌握，化驗單上是壹目了然的。對於第二條，乙肝帶毒者自己就難於掌握，沒有癥狀，轉氨酶不升高，也只有通過肝穿刺來證明了。 1、幹擾素（普通幹擾素、長效幹擾素）
該類藥物的優點是有固定療程、不產生病毒耐藥、HBeAg,HBsAg血清轉換率高且應答持久、具有調節免疫和抗病毒雙重功效；缺點：需皮下註射、價格較高、不良反應較多等（流感樣癥候群、骨髓抑制、精神異常等）有妊娠、精神病、酗酒、失代償期肝硬化、甲狀腺疾病等禁忌癥。
采用幹擾素治療病情階段：病毒載量低於109、高ALT水平、HBeAg低滴度、女性、非母嬰傳播、病程短
2、核苷（酸）類似物
這類藥物的優點是：三性“有效性、易行性、安全性”，但是也有療程不固定、易發生病毒耐藥、停藥後易復發等的缺點。拉米夫定，阿德福韋酯，替比夫定，恩替卡韋，替諾福韋酯，克拉夫定等。
拉米夫定（賀普丁）優點：上市時間最長，療效確切，不良反應少、且進入醫保；缺點：持久應答率低、病毒耐藥率高（14%，38%，49%，66%）。
阿德福韋（賀維力、名正、代丁等）優點：耐藥變異率低（0、3%、11%、18%、29%），對拉米夫定耐藥者仍有效；缺點：抗病毒作用較弱，起效慢，有潛在的腎毒性。
恩替卡韋（博路定）優點：作用強，耐藥率低（5年累計耐藥率1.2%)；缺點: 價格較貴。
替比夫定（素比伏）優點：作用強，HBeAg轉換率高(22%)；缺點：變異率較高，有肌酸激酶升高等副作用，上市時間短，抗病毒作用，長期療效和安全性都有待證實。
拉米夫定耐藥患者優先選擇聯合阿德福韋酯治療，不推薦交替使用阿德福韋酯和換用高劑量的恩替卡韋治療。阿德福韋酯耐藥患者可改用或聯合替比夫定，拉米夫定或恩替卡韋治療。臨床研究顯示，核苷類似物耐藥患者改用幹擾素治療可能是有效的治療方法。
3、中醫中藥
中醫中藥優點是作用機理全面，具有抗病毒、調節免疫、抗炎抗肝纖維化等多重作用，但是卻起效慢，抗病毒的速度難以和西藥相比。
中藥治療乙肝主要適用癥狀明顯的患者、乙肝病毒攜帶者、慢性輕度乙型肝炎、聯合西醫抗病毒藥物治療的慢性乙肝患者、乙肝後肝硬化、合並肝癌的患者。 幹擾素
幹擾素分為常規幹擾素和長效幹擾素，前者基本上天天都要註射，後者多為壹周註射壹次。幹擾素采用肌肉或皮下註射，療程至少需要六個月。幹擾素、核苷類似物等肝病抗病毒西藥以抑制DNA的復制為主，缺點是不能隨便停藥，長期服用乙肝病毒輕易發生變異耐藥。不過長期用藥的話會出現像流感樣、厭食、惡心、腹瀉、抑郁、心絞痛等副作用。
核苷(酸)類似物
另壹類是核苷(酸)類似物的口服藥，像拉米夫定、阿德福韋酯、替比夫定、恩替維卡等。這些藥物也是通過抗病毒，進步免疫力來治療乙肝的。都是治療乙肝中常用的很不錯的抗病毒藥物。拉米夫定能抑制乙肝病毒復制，但缺乏免疫調節功能，但是完全應答率不理想。還有就是阿德福韋、恩替卡韋、替比夫定等，都有不可避開的耐藥性，而且藥價較高。 單純的乙肝抗病毒治療藥物會產生壹些弊端，在乙肝患者在初治選擇療法的時候還是需要謹慎，特別是要註意以下幾點：
1、單純的抗病毒藥物僅能抑制病毒復制，不能完全清除病毒，也就是說它能夠控制病情進展，但不能完全治愈乙肝。甚至有少數患者對某種藥物不敏感，需換用另壹種；
2、療程長（核苷類似物至少為2年，甚至更長時間；幹擾素為1年），藥物需按時應用，切記不能自行隨意停藥。在治療過程中需定期在專科醫生處就診，復查相關指標；
3、同大多數病毒壹樣，乙肝病毒也容易發生變異，有許多患者未用藥也發生了病毒變異（如前C區變異）；同樣在抗病毒治療的過程中，也有可能出現病毒變異，極少數可引起病情突然加重；
4、任何藥物都具有壹定的不良反應甚至出現壹些意外情況。核苷（酸）類似物最常見的不良事件有乏力、呼吸道感染樣癥候群、頭痛、腹部不適和腹痛、惡心、嘔吐和腹瀉、皮疹等；最嚴重的不良事件有乳酸性中毒、腎功能損害、肌酸激酶（CK）升高等。幹擾素的不良反應相對更多。應當在專科醫生處定期隨訪，防範嚴重不良事件的發生。 1、沒有HBV指標，ALT再高也不要貿然應用抗病毒藥，應查找ALT升高的真正原因。
2、急性乙肝時，雖然ALT很高，HBVV也有明顯的復制，但也不宜應用抗HBV藥物，因為急性乙肝病人免疫功能正常，它們能猛烈攻擊HBV，很快會把HBV清除掉，雖然肝細胞有大量損傷，但肝細胞有極強的再生功能，HBV被清除後，能夠很快修復而恢復正常。急性乙肝預後良好，僅有極個別的病人可能轉為慢性乙肝。
3、慢性乙肝，可能是“小三陽”，也可能是“大三陽”，但ALT壹直不高，不超過正常值上限兩倍，臨床實踐證明，這類肝炎使用抗病毒藥的應答率很低，效果不好，他們體內還存在免疫耐受問題，此時可暫不應用抗病毒藥，要註意觀察，定期檢測肝功能。
4、肝活檢有典型的慢性肝炎改變，甚至是早期肝硬化改變的，此時病人ALT即使不高，如有HBV復制，也應當進行抗病毒治療。
5、慢性乙肝時，如果ALT升高超過正常值上限10倍以上，黃疸又非常明顯，這時更不能自己隨意用抗病毒藥，必須請專科醫生診治，經驗證明，這時應用抗病毒藥是非常危險的，而應進行保肝治療，等到病情穩定後才能抗病毒治療。
6、乙肝病人應定期復查肝功能和HBV的指標，過去患過乙肝，ALT正常，這可能是疾病的緩解期，肝內炎癥反應輕，HBV壹般處於比較穩定狀態，不必應用抗病毒藥，可應用免疫調節藥物。
7、乙肝病毒攜帶者，不管“大三陽”還是“小三陽”，也不管HBVDNA陰性或陽性，均不宜應用抗HBV藥物。他們即使有了癥狀，應當先尋找原因，看有無ALT升高，不要急於應用抗病毒藥。 幹擾素治療
1）流感樣：尤其是應用幹擾素的前幾天明顯，突出表現是發熱、體溫長升高可達40℃以上，以38~39℃最常見。壹般在用藥2~4小時開始出現發熱，持續3~5個小時甚至更長。汗出燒退，病人帶有流感樣感覺，乏力、頭暈、頭痛、關節痛、咽喉痛。對生活、學習有壹定影響，生活質量下降。
2）精神癥狀：主要是精神抑郁。治療前如有精神抑郁傾向或性格內向的人輕易發展為抑郁型精神病，值得留意。
3）脫發：發生率較高。用藥3個月後80%以上脫發。
核苷類似藥物
這種藥物功能主要也是抗病毒，進步免疫及恢復肝功。核苷類代表藥物有拉米夫定、阿德褔韋酯、恩替卡韋、替比夫定、克拉夫定、恩曲西地平、替諾福韋、普德福韋、阿巴卡韋等。應用於臨床的核苷類藥品主要是拉米夫定、替比夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋四種。
拉米夫定也有抗病毒作用，且療效明顯，但最大的問題是，在使用拉米夫定半年~壹年左右產生耐藥、病情復發。且要求不能中斷服藥，由於此藥半衰期較短，也就是說服藥後10~15小時，藥物在血中濃度會降低壹半，故不可中斷服藥。
拉米夫定以及其它核苷類抗病毒藥物，固然都能很快抑制病毒，但停藥後，病毒復制很快出現，ALT升高，個別人會發生嚴重肝病，使疾病惡化。這種情況被稱為停藥後反彈或反跳，也叫停藥後肝炎