阜寧縣教育局是縣政府工作部門，為正科級，掛阜寧縣體育局牌子。中國***阜寧縣教育工作委員會與阜寧縣教育局合署辦公，實行壹套工作機構、兩個機關名稱。
阜寧縣教育工作委員會承擔縣教育工作領導小組的日常工作，組織研究教育領域黨建和思想政治建設的政策措施、教育發展戰略規劃、重大改革方案，協調督促落實縣教育工作領導小組決定的工作事項、工作部署和要求等。
內設機構
1、辦公室（縣委教育工委辦公室、縣人民政府教育督導室）。
負責機關日常工作，負責文電、會務、保密、督導、檔案、政務、新聞發布、信訪、安全保密、教育社團管理等工作。; 負責人大建議、政協提案的辦理工作；負責教育系統統戰、群團、老幹部和脫貧攻堅工作的組織領導和具體指導；負責機關固定資產管理工作；協調與兄弟縣（市、區）的教育協作和對口支援工作；承擔縣委教育工委辦公室的日常工作。
2、計劃財務科。
具體負責全縣教育、體育改革與發展的戰略研究和政策研究；協調推進教育現代化綜合改革的有關工作；擬訂全縣教育、體育發展規劃、全縣中小學招生計劃；綜合協調各類教育、體育的布局結構調整以及體制改革工作；承擔全縣公辦中小學的設置、撤並，全縣公辦中小學的設置、撤並、更名、調整等審核工作；協調指導校園建設規劃的制定和實施工作。
3、普教科（縣語言文字工作委員會辦公室）。
承擔全縣普通教育的綜合管理工作；指導全縣義務教育的實施和鞏固工作；指導普通教育教學改革和管理工作；貫徹執行國家和省的辦學標準和教學計劃；協助制定全縣普通教育改革與發展的總體目標並分期組織實施；負責全縣中小學管理工作；協助管理全縣社會力量辦學工作 負責全縣中小學管理工作；協助管理全縣社會力量辦學和合作辦學有關事宜；指導中小學招生和學籍管理工作。
4、職業教育與社會教育科（行政許可科）。
承擔全縣中等職業教育和社會教育統籌協調管理工作；擬訂中等職業教育教學指導文件和教學評估標準；承擔全縣中等職業學校質量建設、常規管理、專業設置、課程建設、教材建設、實訓基地建設、招生就業等具體指導工作；承擔農民文化技術教育、職工教育工作；負責農民文化技術教育、職工教育、老年教育、社區教育、掃盲教育和終身教育體系建設的具體指導工作。
5、體育衛生藝術教育科。
貫徹執行國家、省、市有關學校體育、藝術的法律、法規；承擔全縣中小學體育、衛生與健康、藝術、科技、國防教育及相關教育教學改革等具體指導工作；承擔學生體育競賽和藝術、科技交流活動的組織協調工作；承擔學生體質健康監測的具體組織協調工作；承擔學校食品藥品管理工作。學校食品藥品管理的具體指導工作；承擔學生軍訓、教育系統雙擁工作的指導、協調工作。
6、社會體育科。
承擔社會體育幹部的業務培訓工作；承擔社會體育科研管理工作；指導協調全縣社會體育協會工作；研究體育產業發展，編制體育產業發展規劃，擬訂體育市場和體育活動管理辦法，培育體育市場；負責國民體質測試和體育健身指導工作。
7、組織人事科。
承擔全縣中小學黨建、思想管理和指導工作；按照幹部管理權限，承辦局管幹部的考察、任免等工作；承擔全縣中小學教師隊伍建設的綜合管理工作；擬訂全縣教師隊伍建設規劃和相關政策並組織實施；承擔師德建設和教師培訓指導工作，協調教育、體育系統人才工作，規劃、指導和實施高層次人才選拔、培養和中小學骨幹教師隊伍建設工作。