性味辛，性溫，微毒。
其功效主要是溫中下氣，止痛祛濕，治療血淤所致的肢體疼痛或麻木。祛風可以治療皮膚和皮下肌肉的疾病，以及寒熱引起的咳嗽和嘔吐。吳茱萸還能補益五臟，化痰止咳，驅逐冷氣，治療消化不良，冷調理後胸痛，霍亂轉筋，胃寒，婦女產後心痛。可治全身疼痛麻木，腰腳無力，通氣，痔瘡。能殺三蟲，殺毒蟲，治齲齒，治傳說中的色怪引起的長期發燒。緩解婦女產後出血，驅除腎氣和腳氣水腫，疏通經絡，健脾開胃，促進消化。對於反酸，也可用於治療氣滯神誌不清。治療陽毒、疝氣引起的流口水、頭痛、腹痛。但是封閉的吳茱萸對人有毒有害。吳茱萸吃多了會傷腦子，會頭暈，會酸痛。
發明與傳說李時珍說:山茱萸性熱，能散能溫；苦熱可以燥熱強身。所以它治療的疾病可以散寒溫，使濕氣幹燥，解郁溫。從前，有壹個叫鐘的子鄭。因為不能喝任何東西，每當吃多了或者眼睛渾濁的季節變化，他每10天就發病壹次，感覺頭疼背冷，吐酸水，臥床多日不吃東西，但就醫吃藥都不管用。宣和初年，他成了順昌路斯。在太守財大路接受了吳的處方後，他再也沒有發作過。
附方為:吳茱萸用熱水浸泡七次，茯苓分粉，煉為五子大小的蜜丸。每次用熱水送服50粒膠囊。楊必川的藥方是:將山茱萸用酒浸泡三夜，然後與茯苓的粉末混合，曬幹，每次用溫酒服100粒。如果嗓子疼，舌頭疼，就把山茱萸粉和醋調好，貼在腳上，壹夜就好了。吳茱萸性熱，但能誘熱降，這就是它能治病的原因。