(1)霜黴病
葉片上的病斑呈橢圓形或圓柱形，大小不壹，黃綠色，邊緣不明顯，病部有白色或淡紫色霜黴病。病區上方葉片下垂幹燥，假莖常向傷側彎曲，易折斷。
預防和控制的要點:
①與非洋蔥作物輪作2-3年。
②第5 ~ 6葉期用75%百菌清600倍液、50%敵敵畏500倍液或1 ~ 2mg/kg環己酰亞胺噴施，7 ~ 10天1次，連用3 ~ 4次。
(2)紫斑病
病變多從葉尖中部開始，幾天後可擴散至下部。初期病變很小，略凹陷，黃褐色至褐色。濕度大時，病斑上布滿褐色至黑色的白粉病，常呈同心環狀排列。病斑總會愈合，長成條狀大斑，導致葉片枯死。
預防和控制的要點:
(1)清潔農村，實行輪換2年以上。
(2)加強管理，施足基肥，合理追肥，雨後排水，使植物健康生長，增強抗病能力。
(3)及時防治蔥薊馬，以免造成傷口。
④發病初期噴施75%百菌清可濕性粉劑500-600倍，或64%抗病毒礬可濕性粉劑500倍、58%甲霜靈錳鋅可濕性粉劑500倍，每隔7-10天連續防治3-4次。
(3)生銹
發生於葉片和綠莖，患部初期出現略隆起的褐色瘡皰，呈橢圓形或紡錘形，後期縱向裂開，周圍表皮翻起，釋放橙黃色粉末。最後在患部形成長橢圓形或梭形、深褐色、稍隆起的病竈，病竈破裂後釋放出深褐色粉末。
預防和控制的要點:
①選擇無病洋蔥苗。
②發病初期及時清除病葉，深埋或焚燒。
③施足肥料，註意氮、磷、鉀肥的配合。
④發病初期噴施15%三唑酮可濕性粉劑2000倍液，7 ~ 10天1次，連續2 ~ 3次。
(4)黃矮病
受害葉片黃綠色斑駁，或條狀黃斑，葉片皺縮不平，葉管變形，葉尖逐漸黃化下垂，新葉生長受到抑制，植株矮小、叢生或萎縮，嚴重者全株死亡。大多數病害發生在苗期，病後幼苗生長緩慢或停止，不能形成蔥白，嚴重影響產量和品質。
防治要點:①農業防治:選擇健康、無病毒的種苗和抗病品種；洋蔥地不應與洋蔥幼苗或種子采集地相鄰；加強肥水管理，增強植物抗病能力；勤查田，及時拔除病株，集中掩埋或焚燒；接觸過病株的手和家具要消毒，否則不能接觸健康的植物；要加強病蟲害防治，減少傳播途徑；在耕作操作中註意不要對洋蔥苗造成損傷，以免病毒從傷口侵入。
②化學防治:發病初期及時噴灑100倍83抗過敏劑溶液、500倍20%病毒A可濕性粉劑溶液或300倍1抗毒劑溶液。
(5)大蔥軟腐病
洋蔥軟腐病會危害洋蔥的葉片和花梗。發病初期，第壹至第二葉沿葉脈出現水浸軟的小斑。隨著病斑向葉鞘基部蔓延，葉鞘基部軟化腐爛，散發惡臭，外層葉片脫落。
預防和控制的要點:
①農業防治:選擇抗病、抗逆性強的品種，選擇飽滿、新鮮、無病害的種子；與非蔥蒜作物輪作2年以上；種植前和收割後清理田地，清除田地裏的枯枝和病體，焚燒或深埋；培育壯苗，及時播種，防止田間高溫；增加施用有機肥和適時追肥，促進植物生長健康，加速傷口愈合，增強抗病能力；加強水管理，雨季輕澆、及時排水，降低田間濕度；定期檢查田間病害，及時拔除病株；加強病蟲害防治，重視地下害蟲前期防控，苗期防控各類咀嚼類口器害蟲，減少蟲傷。
②化學防治:發病初期，72%農用鏈黴素可溶性粉4000倍，新植黴素4000-5000倍，抗菌401 500-600倍，77%克殺得可濕性粉劑500倍，50%丁二酸銅可濕性粉劑500倍，或56%水分散粒劑800倍。以上藥物應交替使用。
③貯藏病的防治:晴天采收，充分晾曬，使傷口幹燥變硬，加速愈合；選擇健康、無病、無蟲、無殘疾的大蔥進行儲存，儲存時註意通風，保持低溫在0℃左右。
(6)灰色黴菌
發病初期，從大蔥葉片頂端向下長出白色斑點，呈橢圓形或近圓形，直徑為65438±0 ~ 3mm。隨著病情的發展，病斑擴大成壹片，直至半片或全片葉片卷曲死亡，葉鞘內部組織腐爛。潮濕時，病害長出灰色黴菌層。
預防和控制的要點:
①農業防治:選擇抗病、抗逆性強的品種，選擇飽滿、鮮嫩、無病害的種子，與非蔥、蒜作物輪作2年以上；徹底清除病株，減少田間細菌來源；選擇排水良好的地塊，並采用高壟或壟作，合理密植，使其通風良好；加強水分管理，防止淹水，種植後及時排水，降低田間濕度；配方施肥，不要過量施用氮肥，避免植株徒然生長，降低抗病能力；收獲後，及時清理田裏的病殘屍體，然後深挖泥土。
②化學防治:發病初期，噴灑1000 ~ 1500倍的50%撲爾敏可濕性粉劑，或2000倍的50%速克靈可濕性粉劑，或1000倍的65%萬美靈可濕性粉劑，或50%惠美寧可濕性粉劑500倍。以上藥物任選壹種，交替使用。每隔10天噴1次，連續噴2 ~ 3次。
(7)流行病
致病疫黴葉和花梗。葉片受損時，起初是深綠色的水浸斑，擴大後變成灰斑，圍繞在葉片周圍，導致葉片往往從患病部位塌陷枯萎。陰雨連綿或濕度大時，病害長出稀疏的白黴菌，天氣幹燥時，白黴菌消失，撕開表皮可見到棉絮狀白色菌絲體。病情嚴重時，病葉腐爛，全株死亡。
預防和控制的要點:
①農業防治:選擇抗逆性、抗病性強的品種，選擇飽滿、新鮮、無病害的種子，與非蔥、蒜類蔬菜輪作2年以上；種植時選擇壯苗，淘汰病苗、弱苗、殘苗；徹底清掃田間，清除病殘植物，減少田間細菌來源；選擇排水良好、地勢高燥的地塊進行種植，並采用高壟或壟作種植，合理密植，使通風良好；加強用水管理，雨後及時排水，降低田間濕度；采用配方施肥，促進植物健壯生長，增強抗病能力；適時中耕除草。
②化學防治:壹是播前種子處理，用相當於種子重量0.3%的25%福美雙拌種。二、發病初期，可用75%百菌清可濕性粉劑500倍、50%多菌靈可濕性粉劑500倍、25%毒黴可濕性粉劑800倍、64%抗病毒礬可濕性粉劑500倍、1500 ~ 2000倍50%速殺粉，或58%霜劑。以上藥劑應交替使用，每隔7 ~ 10天噴1次，連續噴2 ~ 3次。
(8)白腐
苗期和成株期均可發病。苗梢受損傷變黃，後期全葉灰白色死亡，最後幼苗枯萎死亡。成株發病時，葉片從葉尖開始變黃然後死亡，植株矮化枯萎，莖基部組織變軟，然後幹枯腐爛，微凹灰黑色，沿莖基部向上膨大，地下部分變黑腐爛。濕度大時，葉鞘表面或組織上有許多白色黴菌，變成灰黑色，迅速形成大量黑色球形菌核。菌核圓而小，常相互重疊形成菌核塊，菌核塊厚度有時可達5毫米左右。
預防和控制的要點:
①農業防治:選擇抗病或抗逆性強的品種，選擇飽滿、新鮮、無病害的種子或無病害的蔥苗；與非洋蔥和大蒜蔬菜輪作2年以上；選擇排水良好、地形幹燥的地塊進行種植；加強肥水管理，雨後及時排水，降低田間濕度；徹底清掃農村，清除病殘，減少田間病菌來源；加強田間巡查，及時焚燒或掩埋被連根拔起的植株，並在病株上撒石灰或草木灰進行消毒；要進行配方施肥，不要偏施氮肥，要多施磷鉀肥，增強植物的抗病能力。
②化學防治:除播前用相當於0.3%重量的50%撲爾敏可濕性粉劑拌種外，50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，70%甲基硫菌靈可濕性粉劑800倍液，或50%撲爾敏可濕性粉劑1000 ~ 1500倍液，或68倍液。
(9)炭疽病
炭疽病主要發生在葉片和花梗上。葉片受損時，原發病竈近梭形或不規則的灰褐色至褐色，無邊緣。後來隨著病情的發展，病竈上散在小黑點，即病原體的無臍點。病情嚴重時，上部葉片死亡。
預防和控制的要點:
①農業防治:選擇抗病品種，將種子留在無病或無病植株上，防止種子帶菌；與非洋蔥和大蒜蔬菜輪作2年以上；選擇排水良好、地勢高燥的地塊進行種植，種植密度合理，通風良好。種植時選擇壯苗，淘汰病苗、殘苗、弱苗；實施配方施肥，增強植物抗病能力；加強用水管理，適當澆水，雨後及時排水，降低田間濕度；收獲後徹底清掃田地，經常檢查田地情況，及時清除病株。
(2)化控:播種前用300倍福爾馬林溶液浸泡種子3小時，取出，沖洗幹凈，晾幹後播種；發病初期噴施75%百菌清可濕性粉劑600倍，80%炭疽福美雙可濕性粉劑800倍，70%代森錳鋅可濕性粉劑500倍，64%抗病毒礬可濕性粉劑500倍，或50%甲基硫菌靈可濕性粉劑500倍。以上任何壹種藥劑均可交替使用，每10天噴灑1次，防治1 ~ 2次。
(10)葉黴
這種疾病危害樹葉。發病初期，葉片上有水浸黃化斑。隨著病情的發展，形成大小不壹的不規則深綠色斑，略呈凹形。後期，病斑上長出壹層濃密的黑色平絨層。當病情嚴重時，葉子會幹枯死亡。
預防和控制的要點:
①農業防治:與非蔥、蒜類蔬菜輪作2年以上；選擇排水良好、土壤肥沃、地勢高燥的地塊進行種植；種植時選擇壯苗，淘汰病殘苗和弱苗；合理密植，保持株間良好的通風和透光；加強用水管理，雨後及時排水，降低田間濕度；配方施肥可以防止植物白長，增強植物抗病能力；定期實地檢查，及時清除病株；收割後徹底清潔田地，減少田間病菌來源。
②化學防治:發病初期噴施50%多菌靈可濕性粉劑500倍、40%多硫懸浮劑500倍、50%混硫懸浮劑500倍、80%代森錳鋅可濕性粉劑600倍或50%苯菌靈可濕性粉劑1500倍。以上藥劑任選壹種，交替使用，每隔7 ~ 10天噴1次，連續噴2 ~ 3次。
(11)黑點
主要危害葉片和花梗。植株受害時，初生白斑被水浸泡，隨著病情發展，變成灰色或淡褐色橢圓形或梭形病斑，略凹陷。後期病變增大，周圍有黃色暈圈，有暗或深灰色黴菌呈同心圓狀排列。病情嚴重時，病斑相互連接或在葉片或花梗周圍擴展壹周，使葉片或花梗折斷或整葉死亡。
預防和控制的要點:
(1)農業防治:選擇抗病品種，選擇飽滿、新鮮、無病蟲害的種子；與非洋蔥和大蒜蔬菜輪作2年以上；選擇排水良好的地塊，合理密植，使植物通風通透；實施配方施肥，防止植物早衰，提高植物抗病能力；合理灌溉，雨後及時排水，降低田間濕度；定期實地檢查，及時清除病株；收獲後，地裏的病殘屍體被全部運走，集中掩埋或焚燒。
②化學防治:發病初期噴施1500倍50%撲爾敏可濕性粉劑、500倍64%抗病毒礬可濕性粉劑、800倍58%甲霜靈錳鋅可濕性粉劑、600倍75%百菌清可濕性粉劑或600倍70%代森錳鋅可濕性粉劑。選擇上述藥劑中的壹種交替使用，每隔10天噴灑1次，連續噴灑2 ~ 3次。