子實體階段的牛樟芝多糖含量不高，約為2%，與壹般食藥用草菇所含多糖相同。具有免疫生理活性、腫瘤防治等生理活性，主要含有β-D-葡聚糖(β-D-葡聚糖)。其作用是通過刺激巨噬細胞、T淋巴細胞、B淋巴細胞和自然殺傷細胞來增強免疫功能，從而達到抗腫瘤的效果。牛樟芝多糖具有強心、降血壓、降血糖、抗血栓的作用。(萜類化合物)
三萜類化合物是樟芝子實體中最常見的萜類化合物，通常被認為是樟芝提取物中苦味成分的主要來源。其中，超過65，438+00個新發現的三萜化合物是樟芝所特有的。實驗證實，這些三萜類化合物可抑制肝癌細胞增殖，毒化小鼠血液癌細胞活性，抗副交感神經作用，抗血清素活性，激活神經細胞生長能力。它在調節抗腫瘤活性方面的作用比多糖更重要。高血壓患者常因高血壓引發中風，導致腦血管破裂。三萜類化合物能有效抑制血管緊張素轉換酶(ACE)的活性，從而降低血壓。
2006年，臺灣省立大學化學系郭教授從樟芝子實體中分離出壹系列二萜類化合物，發現它們具有神經保護活性。
2007年，臺灣省塔真大學藥學系暨制藥技術研究所陳日榮教授研究團隊，從牛樟芝子實體中分離獲得具有抗炎作用的含苯環及三鍵的特殊化學結構化合物。(超氧化物歧化酶)
ROS:活性氧可由外界環境或體內代謝(如紫外線照射、輻射或化學反應)產生。最常見的活性氧是過氧化物自由基和氫自由基。這些活性氧往往會對人體造成許多病理變化，如細胞降解引起的DNA損傷、致癌和衰老等。超氧化物歧化酶是生物體內清除超氧自由基的主要酶，具有很高的抗氧化功能，能有效控制活性氧引起的病變，清除自由基。包括腺苷、核糖核苷酸(RNA)、腺嘌呤、尿嘧啶等物質，都具有重要的生理活性，其中腺苷具有抑制血小板聚集、防止血栓形成和動脈硬化的作用。
此外，近年來還發現樟芝的子實體由酚類、甾醇類、醇類和內酯類組成，其藥理作用正在研究中，相關結果將在以後報道。