臨床上，胰腺假性囊腫的早期發現應采用內科保守方法治療。
(1)如果急性胰腺炎伴有內科治療，應使胰腺處於靜止狀態，以減少胰液外滲，控制囊腫的進壹步發展。方法:嚴格禁食3周左右，應用H2受體拮抗劑和生長抑素進行胃腸減壓，減少胰酶和膽囊收縮素-胰高血糖素的分泌，使胰腺分泌功能處於靜止狀態；維持水電解質平衡，提供靜脈營養支持等。，並在早期應用可透過血胰屏障的抗生素，如喹諾酮類和氯、林可黴素等抗生素，以預防和治療胰腺感染。中晚期選用第三代頭孢菌素、氨基糖苷類等廣譜抗生素。
(2)單純細針抽吸復發率高達50% ~ 98%。反復穿刺不僅給患者帶來痛苦，還容易導致逆行感染。
(3)經皮穿刺置管引流(1)適應證:急性胰腺假性囊腫，經b超CT證實為單房性，有以下情況:囊腫因迅速增大可能破裂；囊腫合並感染；囊腫會極大地壓迫周圍的器官，導致功能障礙。(2)方法通常在b超或CT引導下進行。8號FJ管，每天用抗生素生理鹽水沖洗1 ~ 2次。③拔管提示囊腫塌陷；24小時引流液
(4)內鏡治療可采用內鏡囊腫胃腸吻合術和內鏡囊腫十二指腸吻合術。對於胃腸壓迫癥狀，直徑>；6 cm以上的胰頭囊腫選擇內鏡治療比較安全，尤其是位於十二指腸旁的，不適合手術治療。這種方法特別適合不能耐受手術的老年人。
2.外科療法
(1)胰腺假性囊腫的囊壁由炎性纖維結締組織構成，與周圍器官緊密粘連，勉強分離時容易造成出血和周圍器官損傷。切除適應證僅限於:①慢性胰腺炎合並胰管梗阻誘發的慢性胰腺假性囊腫。此類囊腫外引流往往無效，內引流復發率高；②胰腺尾部多房性胰腺假性囊腫內外引流不暢；③胰頭十二指腸切除術只能在胰頭囊腫不能排除或同時考慮治療慢性胰腺炎因素的情況下進行；胰尾胰腺假性囊腫可在胰尾切除。如果囊腫與脾臟分離緊密，容易導致大出血，特別是30歲以上的成年人，可以考慮切除囊腫、胰尾和脾臟。
(2)每根內部排水管的直徑>；厘米，囊壁成熟的囊腫。壹般時間是6周，因為6周後囊壁已經很厚了，不容易自然褪色。CT掃描對判斷囊壁是否成熟具有重要價值。慢性胰腺假性囊腫，特別是伴有胰管狹窄者，可考慮進行此手術。
(3)手術吻合①膀胱十二指腸吻合術膀胱十二指腸吻合術易出現出血、膽瘺、胰瘺等嚴重並發癥，需慎重選擇，謹慎操作。②囊腫胃吻合術的優點是胃蠕動強，有助於排空囊腫，加速囊壁塌陷。同時，進入囊腔的胃內容物可以抑制胰腺內各種酶的活性，防止酶對囊壁的腐蝕。缺點是未消化的胃內容物進入囊腔會引起囊腔繼發感染，堿性胰酶進入胃內刺激胃竇，導致胃泌素大量分泌，可誘發消化性潰瘍的發生。
(4)外引流有很多缺點，如易腐蝕皮膚，大量丟失水分、電解質、蛋白質和胰液，術後處理困難。囊腫復發率為265，438±0% ~ 28%。方法:①制袋這種方法具有外引流的所有缺點，如每天換藥、易逆行感染、傷口不易愈合、易形成胰瘺等。所以只用於全身情況不好，囊壁離腹壁很近的情況。②蘑菇管或T管引流發現囊腫。在切割和處理囊腫的內容物後，放置T管或蘑菇引流管，並間歇地關閉囊腫的切口。引流管穿過網膜，另壹個孔戳出體外。這種方法可以避免對皮膚的腐蝕，不需要每天換藥，可以減少逆行感染，不會影響傷口愈合。
(5)近年來，囊腫胃壹期內外引流和囊腫空腸Roux-en-Y內外引流取得了滿意的效果。這種方法既有內引流和外引流的優點，又能摒棄兩者的缺點。