目前對eb病毒感染沒有特別有效的藥物。如果病情沒有得到很好的控制，就需要對癥治療，比如出現高熱的時候就吃藥退燒。有壹些造血系統紊亂和癱瘓時可考慮激素治療，有其他細菌感染時應進行抗感染治療，多數患者可恢復良好。惡性腫瘤的慢性感染需要腫瘤的專門治療。大多數eb病毒感染後可以自行恢復，但仍需到醫院檢查、診斷和治療，明確診斷。
愛潑斯坦-巴爾病毒屬於皰疹病毒家族，感染後可引起傳染性單核細胞增多癥和慢性活動性eb病毒感染。愛潑斯坦-巴爾病毒感染大多是自限性的，壹般不需要特殊治療。對於eb病毒感染引起的發熱、皮疹、心絞痛、肝脾腫大，以對癥支持治療為主。急性期需要臥床休息，補充能量和水分。肝損傷嚴重者需要使用保肝藥物。嚴重者可使用泛昔洛韋或伐昔洛韋進行抗病毒治療，嚴重癥狀如嚴重血小板減少、溶血性貧血、中樞神經系統受累、心肌炎等可使用皮脂類固醇進行治療。
EB病毒感染與鼻咽癌、兒童淋巴瘤、傳染性單核細胞增多癥密切相關。但臨床感染後，並沒有直接的抗病毒治療。這些疾病的治療主要針對疾病本身，如放療、血液治療，以及其他對癥支持治療，缺乏直接的抗病毒藥物。就EB病毒本身而言，並不意味著感染後壹定會發生這些疾病，只是增加了這些疾病的誘因或風險。目前缺乏針對病毒本身的治療方法。