長期在空調房內，會導致汗腺關閉，影響正常的新陳代謝和分泌；長時間坐著不動，不運動，會造成頸部運動不平衡，影響頸部肌肉、神經、脊髓、血管。久而久之會導致局部頸椎病，從落枕、僵硬、疼痛、肩背沈重、上肢無力、手指麻木，到頭痛、頭暈、視力下降、惡心等異常感覺，甚至大小便失控。
在空調房裏也要註意改善固定的坐姿。工作和看電視約1小時後，應改變姿勢，或做短暫的頸部屈伸和自然的左右旋轉，以改善頸部的血液循環，緩解頸部的肌肉疲勞。長時間伏案工作的人，要註意書桌和座椅的高度，盡量避免過度彎腰屈頸，最好使用可移動的半坡傾斜書桌。
壹旦冷空氣突破呼吸道脆弱的“防線”，出現咳嗽、打噴嚏、流鼻涕等感冒癥狀，即上呼吸道疾病。這種感冒通常被稱為感冒。壹方面是因為經常出入空調房，身體無法適應溫度的不均；二是因為空調房都是封閉的，房間裏人多，空氣流通差。如果壹個人出現感冒癥狀，很快就會傳染給其他人。
空調導致嚴重的下呼吸道疾病，尤其是肺炎。特別是在中央空調下工作學習時，中央空調非常適合軍團菌的傳播，潛伏期約為2~12天。上呼吸道雖無反應，但有發熱、寒戰、肌肉酸痛、幹咳、無痰或少痰。如果不及時治療，會持續發熱、幹咳、發冷。