加強支持和對癥治療，控制感染，維持營養和水電解質平衡。對於球麻痹、吞咽困難和呼吸衰竭的患者，應采用鼻飼、氣管切開和人工輔助呼吸。顱內壓增高者應給予脫水劑和皮質類固醇以改善神經癥狀。
2.外科療法
腦幹腫瘤曾經被認為是手術的“禁區”，因為在壹個很小的區域內，腦幹內有很多神經核團、傳導束和網狀結構。腦幹腫瘤多為浸潤性膠質瘤，手術難度大，易造成腦幹內重要結構損傷，手術致殘率和死亡率高，預後差。近年來，隨著顯微外科技術的快速發展，腦幹腫瘤的手術效果得到了顯著提高。盡管腦幹腫瘤手術仍存在較大風險，但對於局限性、結節狀或囊性、分化良好的腫瘤，應積極采取手術切除，預後良好。對於良性腦幹腫瘤，可通過全切除達到根治效果。
這類腫瘤的手術目的是:①明確腫瘤的性質；②恢復腦脊液循環；③良性腫瘤應爭取全切除或次全切除，如ⅰ級星形細胞瘤、血管網狀細胞瘤或結核瘤等。，且有望全切除達到治愈效果；④惡性腫瘤也應全切除，或次全切除或部分切除，以達到充分的內部減壓效果；⑤術後放化療可延長膠質瘤患者的生存時間。
3.放射療法
長期以來，放射治療被認為是治療腦幹腫瘤的主要方法。對於根據臨床和影像學檢查可確診的腦幹腫瘤，可進行放射治療。70% ~ 90%的患者在接受1療程放療後癥狀和體征有所改善。壹般總放射劑量為50 ~ 55Gy (5000 ~ 5500 rad)，療程為5 ~ 6周。6Gy以上，容易造成腦輻射損傷。放射治療可以單獨進行，也可以與術後治療相結合。
4.化學療法
常用藥物有尼莫司汀(ACNU)、卡莫司汀(BCNU)、環己基亞硝脲(CCNU)等。應根據患者的病情、年齡、體重合理用藥。