1.農業控制
(1)選擇優良品種:辣椒如早雜2號、中紫、項燕4號、5號、6號、中紫、細線椒等甜椒如魯椒1、奇椒1、孟郊3號、哈椒2號、魯椒3號、早雜2號、蘇椒2號、早豐1、奇椒1、萬椒2號、長豐、吉農焦芳等。
(2)滅菌育種:用4%農抗120瓜菜煙專用液100倍浸種12小時，取出，冷卻半幹，直接播種。也可將種子用冷水預浸1-2小時，再用55℃溫水浸泡10分鐘或用50℃溫水浸泡30分鐘，取出後用清水沖洗幹凈，冷卻後催芽播種。
也可將種子用冷水浸泡10-12小時，再用1%硫酸銅溶液浸泡5分鐘，取出，加入適量熟石灰或草木灰拌種，立即播種。或用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液浸種1小時，清水沖洗，催芽播種。
(3)合理輪作:作物與小麥、玉米等禾本科作物輪作2-3年，避免與瓜菜連作。而且地勢高且幹燥，排灌方便，通風良好。
(4)加強栽培管理:種植前深挖土壤，多施優質腐熟有機肥，多施磷鉀肥，提高植物抗病能力。根據品種特點和水肥條件，合理密植，避免過密種植，采用高矽栽培和地膜覆蓋，促進辣椒根系生長。
棚內應及時通風除濕，避免高溫高濕；雨後及時排水，防止地面積水，保護根系。對於沒有覆膜的，在生長前期要多中耕少澆水，提高地溫，增強植株抵抗力。夏季炎熱幹燥，適合傍晚澆水，降低地面溫度。及時采收，及時清除病葉、病果和殘株。
2.化學防治
發病初期可噴施500倍的65%代森鋅可濕性粉劑和1000倍的50%托布津可濕性粉劑；50%多菌靈可濕性粉劑800倍液；每隔7~10天噴75%百菌清可濕性粉劑500~600倍或70%代森錳鋅可濕性粉劑400倍，連續23次。