(1)化學解毒法
在棉籽餅中加入壹些化學物質可以破壞棉酚或使棉酚變成結合態。
(1)硫酸亞鐵浸泡法:將粉碎的棉籽餅用1%硫酸亞鐵溶液浸泡約1天，硫酸亞鐵溶液用量為棉籽餅重量的5倍，浸泡後棄去處理液，再用清水浸泡兩次，可直接與其他混合物混合飼餵。如果將棉籽餅和菜餅以1∶2的比例混合，不僅可以提高蛋白質的利用率，還可以降低兩者的毒性。該方法具有效果好、成本低、簡單易行的優點。
(2)堿處理:加入燒堿(苛性鈉)或純堿(碳酸鈉)的水溶液、石灰乳等。放入餅中，加熱蒸煮，使餅中的遊離棉酚被破壞或處於結合狀態；也可以將餅用堿水浸泡，然後用清水洗凈，餵飽。但這種方法會溶解和損失蛋糕中的壹些蛋白質和無氮提取物，會降低蛋糕的營養價值。
(2)熱處理
將碾碎的棉籽餅大火煮2小時，可大大降低毒性。倒掉處理液，用清水浸泡2 ~ 3次後使用。也可以通過烤等方式加熱。使棉酚與蛋白質結合，解除毒性。
(3)微生物發酵解毒法
將棉籽餅與其他飼料混合，加入發酵粉，然後加水攪拌均勻，放入密閉容器中儲存至產生酒香。