蟲害
花椒天牛屬於鞘翅目，天牛科。5月，幼蟲以木質部為食，並從蟲道排泄糞便。空腔壹般為0.7 cm× 1 cm，扁圓形，與軀幹呈45°角向上傾斜。幼蟲5齡，老熟幼蟲在蟲洞化蛹。6月，受損的胡椒樹開始枯萎。[9]
四川胡椒
預防和控制方法:
(1)消滅蟲源:及時收集當年枯死植物，集中焚燒。
(2)人工捕殺:在7月陽光明媚的上午和下午人工捕殺成蟲。
③生物防治:川硬皮腫腿蜂是天牛科的天敵。7月晴天，按每株受害植株5-10條川硬皮腫腿蜂的標準，在受害植株上放置天敵。實踐證明，應用川硬皮腫腿蜂防治天牛是有效的。[9]
花椒介殼蟲是同翅目蚧總科中危害花椒的介殼蟲的總稱，包括草地介殼蟲、桑樹介殼蟲、楊樹介殼蟲和梨園介殼蟲。它們都是依靠自己獨特的吮吸口器來吮吸植物芽、葉、枝的汁液。造成枯枝黃葉，樹勢衰弱，嚴重者死亡。[9]
預防和控制方法:
由於成蟲的介殼蟲表面覆蓋有蠟或殼，化學藥劑難以滲透，防治效果不好。因此，蚧蟲防治的重點在若蟲階段。[9]
①物理防治:冬春季用草柄或刷子殺滅樹幹或樹枝上繭內越冬雌蟲和雄蛹。
②化學防治:可選用內吸性殺蟲劑，如氧樂果1000倍；尤其是40%速度剔除800-1000次有效。
③生物防治:自然界中介殼蟲的天敵很多，如壹些寄生蜂、瓢蟲、草蛉等。[9]
花椒紅蜘蛛生活史及習性(山楂葉蟎，山楂葉蟎):壹年發生6-9代，以受精雌成蟲越冬。辣椒發芽就開始危害了。第壹代幼蟲在花序延長期開始出現，盛花期危害最大。交配後，它們在葉背主脈兩側產卵。花椒的紅蜘蛛也可以孤雌生殖，然後是雄性。每年發生的嚴重程度與該地區的溫度和濕度有很大關系，高溫和幹旱有利於發生。[9]
預防和控制方法:
①化學防治:必須抓住關鍵時期，在4-5月用25%殺蟎劑500倍液和73%炔蟎特3000倍液防治害蟎；或用內吸殺蟲劑氧化樂果1000倍；40%速度撲殺800-1000次。
②生物防治:害蟎有很多天敵，如壹些捕食蟎、瓢蟲等。田間盡量少用廣譜農藥，保護天敵。[9]
花椒癭蚊，又稱幹花椒癭蚊。可使傷枝因刺激而增生，形成柱狀癭，阻礙傷枝生長，後期幹枯，常造成樹木衰老死亡。[9]
預防和控制方法:
(1)剪去病蟲枝，在修剪口及時貼上胼胝防腐膜保護傷口，防止病菌入侵。及時收集害蟲枝條，焚燒或深埋，塗在樹上，防止病菌落在樹上，降低病菌存活率。
②化學防治。辣椒收獲後，及時噴灑針對性化學藥劑和新型高脂膜，增強藥效，防止空氣傳播細菌的入侵。棉花浸過的化學藥品塗在腫瘤上，整個花園噴灑管叔消毒。[9]
疾病
花椒根腐病常發生在苗圃和成椒果園。這是壹種由腐生鐮刀菌引起的土傳疾病。受害植物根部變色腐爛，有異味，根皮與木質部分離，木質部呈黑色。地上的葉子又小又黃，樹枝不發達。在嚴重的情況下，整株植物都會死亡。[9]
預防和控制方法:
①合理調整布局，改善排水不暢、環境潮濕的椒園，使其通風幹燥。
②做好苗期管理，用15%三唑酮500-800倍液對催芽圃土壤進行消毒。高畦深溝，重施底肥。及時拔除病秧。
③移栽幼苗時，用50%甲基托布津500倍液浸泡根部24小時。用生石灰給土壤消毒。用500-800倍的甲基硫菌靈溶液或500-800倍的15%三唑酮溶液澆灌根部。
④4月份用300-800倍的15%芬怡寧溶液澆灌成年樹根部，可有效預防病害。夏季灌根可以減緩病情的嚴重程度，冬季灌根可以減少病原菌的越冬結構。
⑤及時挖出枯死的樹根、樹木，焚燒，消滅病菌。[9]
花椒銹病是花椒葉的重要病害之壹。廣泛分布於陜西、四川、河北、甘肅等省的辣椒種植區。嚴重時辣椒提早落葉，直接影響次年結果。發病初期，葉片正面出現2-3毫米的水漬褪綠斑，與病斑相對的葉片背面出現橙黃色水泡，為夏孢子堆。這種疾病是由花椒柄銹菌引起的。花椒上發生夏孢子和冬孢子。辣椒銹病的發生主要與氣候有關。在降雨較多的情況下，尤其是第三季度，危害容易發生。[9]
預防和控制方法:
(1)化學防治:在病害未發生時，可噴灑波爾多液或0.1-0.2%的坡美石灰硫合劑，或在6月初至7月底用200-400倍的氰戊菊酯噴灑辣椒樹。
②化學防治:噴灑15%三唑酮可濕性粉劑1000倍，控制夏孢子的產生。在發病高峰期，可噴灑1: 2: 200倍波爾多液，或0.1-0.2鮑美施硫混劑，或15%可濕性粉劑1000-1500倍液。
③加強肥水管理，鏟除雜草，合理修剪。深秋時節，雕落物中的雜草要及時清除和焚燒。
④培育抗病品種，抗病能力強的辣椒品種可以混種。[9]
花椒膏藥病是花椒的常見病害，其病原為擔子菌亞門的穗。擔子果像膏藥，貼在花椒的枝頭。較輕的使枝條生長不良，果實較少；最壞的情況下，樹枝會枯死。很多地區花椒枝條和全株枯死，少果少果，與膏藥病有關。石膏病的發生與樹齡、濕度、品種有關。據調查，辣椒膏藥病主要發生在陰涼潮濕的成椒果園；此外，該病的發生與介殼蟲的危害有關，膏藥病是靠介殼蟲分泌的蜜露來滋養的，所以受介殼蟲危害嚴重的辣椒果園，膏藥病的發生也很嚴重[9]
預防和控制方法:
①加強管理，適當修剪，清除雕落物，降低椒園濕度。
②控制種植密度，尤其是盛果期的成熟辣椒園。如果太背陰的話，就要適當減薄。
③將博美4-5度石硫合劑塗抹在病斑上。
④加強介殼蟲的防治。[9]
花椒流膠病由真菌引起，傳染性很強。可迅速引起樹幹基部韌皮部壞死、腐爛、流膠病，導致葉片發黃、枯枝。[9]
預防和控制方法:
(1)清理花園消毒，冬季清掃應徹底，將害蟲和樹葉集中焚燒或掩埋，同時對整個花園噴灑壹般樹木保護消毒。
(2)及時噴藥，做好預防工作，及時增加有機肥的施用，在發病初期及時噴藥殺菌。及時施用管叔防治花椒的樹膠病，可以疏通疏通管道，提高植物的抗逆性。
(3)用足量的肥和水根除雜草，在花椒的蕾期、幼果期、果實膨大期各噴壹次修剪葉面肥，以提高花椒的抗病能力，使花椒皮厚、椒果濃、色澤鮮艷、自然味濃。
④化學防治。流膠病(幹腐病)常伴有天牛發生，需及時防控天牛等病蟲害的發生，配合噴灑針對性化學藥劑和新型高脂膜，增強藥效，防止空氣傳播細菌的入侵，並在全園噴灑通用護樹劑進行消毒。