因此，解決城市河流汙染，恢復河流的生態和社會功能，仍是許多城市可持續發展過程中亟待解決的重點任務之壹。以下是黑臭水體的治理方法:
物理方法:①通過“清汙釋汙”稀釋汙染水體，降低黑臭水體的關鍵水質指標，如總磷、有機汙染指數、高錳酸鹽指數濃度等。但對於蓄水量大的水域，補水量太少達不到凈化效果，增加補水量會造成水資源的大量浪費，成本高。因此，“引水釋汙”只是起到了“治標不治本”的暫時效果，對於富營養化嚴重的湖泊來說，並不是長久之計。
(2)清淤疏浚底泥可以減少湖泊中積累的大量有機碳、氮、磷等營養物質，增加湖泊的蓄水量，是減少內源汙染、減少水體黑臭的有效途徑和措施。然而，大規模疏浚可能會破壞湖泊原有的生物種群結構和棲息地，削弱其自凈功能，給生態恢復帶來負面影響。
2.曝氣復氧法:曝氣復氧對消除水體黑臭的良好效果已被國內壹些實驗室試驗和河流曝氣中試所證實。其原理是進入水體的溶解氧與黑臭物質(H2S、FeS等還原性物質)發生氧化還原反應。對於長期處於缺氧狀態的黑臭河流，水生態系統恢復正常狀態壹般需要較長時間，水體曝氣復氧有助於加快這壹過程。河流曝氣復氧因其效果好、投資和運行成本相對較低，已成為美國、德國、法國等壹些發達國家和韓國、香港等中等發達國家和地區中小汙染河流汙染控制的常用方法。對於汙染嚴重和長期汙染的水體，需要生物方法和生態措施，可以作為輔助生物-生態修復的方法之壹。
3.化學法:化學絮凝處理技術是壹種通過添加化學藥劑去除水層中的汙染物來改善水質的汙水處理技術。近年來，化學絮凝處理技術在提高城市汙水壹級處理效果方面得到了越來越廣泛的研究和應用。隨著水汙染形勢的日益嚴峻，對黑臭水體等嚴重汙染水體的快速高效處理也顯示出其壹定的優勢。但是，化學絮凝處理的效果容易受到水環境變化的影響，而且必須考慮到化學品對水生生物的毒性和對生態系統的二次汙染，因此該技術的應用有很大的局限性。
4.生物方法:細菌酶？1011系列生物復合酶是壹系列含有多種酶的天然有機復合產品，是由非離子表面活性劑、其他天然成分、蛋白質、無機營養成分結合合成的高效復合酶凈化劑。機理:生物復合酶能刺激和加速微生物的反應，同時能促進水中大分子化合物分解成小分子化合物，同時釋放結合氧，增強水體復氧功能。這些簡單的化合物容易被微生物利用，有利於微生物的多樣性，提高微生物的活性和繁殖能力，達到微生態平衡。
在大多數環境中，有許多由土著微生物進行的自然凈化過程，但由於缺乏溶解氧(或其他電子受體)和營養物質，該過程非常緩慢，另壹個限制因素是有效微生物往往生長緩慢。生物復合酶能有效刺激和加速自然生物反應，激發土著微生物的活性，加速微生物的生長和繁殖，對浮遊生物和環境無害。從而快速有效地促進受汙染水體向良性生態系統演替，使水體中的DO得到恢復，COD、BOD5、NH3-N等汙染指標迅速降低，水體黑臭現象迅速消除。
特色1——高效消除黑臭，修復生態系統Bcato-Zyme？1011速效生物復合酶能快速消除水中黑臭；和Bcato-Zyme合作？1011還原營養復合酶能快速還原水中的汙染物，使水？COD、BOD5、氨氮等汙染指標快速改善。同時，激活底泥中的土著好氧微生物，提高其生化反應效率，減少溶解氧的消耗，促進溶解氧的恢復，逐步改善水體微生態系統。即通過微生物對水體進行生態修復，重建底層生物鏈，為上行生物鏈的梯級恢復奠定基礎，為底棲生物的植入創造底質條件；提高水體透明度，為水生動物放養創造水質條件。通過人工控制生態環境，水生動植物和水環境可以達到動態平衡。
特點二——標本兼治生物技術治理河湖汙染，不僅治理水體，還治理河湖沈積物。生物修復治理不僅是為了達到水質的標準，也是為了通過階段性的治理，徹底恢復河湖沈積物的活性，使河湖恢復自凈能力，達到生態平衡。
特點三——施工簡單，原位處理邦元環保河湖生物處理過程中使用的設備簡單，不需要挖掘機等大型設備，所以施工方便，操作簡單，不會產生噪音，不會影響周圍居民的正常生活；最重要的是原位標本兼治。在施工過程中，不需要轉移泥沙，消除了汙染物的轉移和對環境的二次汙染。而且在原有底泥的基礎上，經過處理，刺激原有土著微生物快速生長繁殖，形成種群優勢，恢復底泥活性，達到水體長期自凈效果。經過生物修復，底泥恢復了活性，不僅不需要清淤，還可以大大提高河流的自凈能力。特點4——產品綠色環保無汙染。
①生物制品不燃、不揮發、綠色、安全、無毒、無二次汙染。
②兼容性好。由於該抑制劑無毒副作用，可與其他生物制劑聯合使用，具有協同作用。
③生物降解性優異。抑制劑抑制水中浮萍生長後，不會有殘留。
4.生物生態修復技術生態生物法是近年來發展起來的壹種新的環境生物技術。這類技術主要是利用微生物、植物等生物的生命活動，轉移、轉化、降解水中的汙染物，從而凈化水質，創造適合多種生物生存繁衍的環境，重建和恢復水生生態系統。因為這種技術具有處理效果好、工程造價相對較低、無或低能耗、運行費用低等優點。同時，沒有任何化學物質投入水體，不會造成二次汙染。也可與綠化環境、景觀改善相結合，創造人與自然融為壹體的優美環境。因此，它已成為水汙染和富營養化控制的主要發展方向。生態生物修復技術包括:微生態系統修復技術、人工濕地技術、浮島技術、植物控制技術、生態護岸技術、生態復氧技術、生態疏浚技術、水生動物恢復與重建技術等。在實際工程應用中，可根據水汙染程度、水環境現狀和水體功能選擇不同的技術組合，從而呈現生態效益和經濟效益雙贏的局面。
公司利用生物方法和生物生態修復技術，在北京、江蘇、山東、海南、河北、雲南等地完成了數十個項目，具有豐富的水處理經驗。可提供系統整體解決方案，陽光24小時跟蹤服務機制。
因為內河治理的最終目的是恢復河流生態系統的功能和結構，促進系統的自我維護和自我發展。應用型生物生態修復技術被認為是21世紀中國生態環境保護領域最具價值和生命力的生物治理技術。