藥物治療是指使用壹種或多種藥物進行局部或全身治療，以糾正病禽的病理狀態，促進正常生理功能的恢復。藥物治療包括病因治療和對癥治療。針對治療引起疾病的原因，選擇相應的藥物進行具體治療，從而達到以消除疾病為主要目的的治療方法。對癥治療是針對臨床癥狀，選擇能緩解癥狀的藥物，旨在改善禽類整體身體狀況，促進康復，常用於病因不明或病因明確但病情嚴重時。事實上，兩者經常結合使用。根據禽類的特點，結合具體疾病，給藥方法有很多種。
(1)通過物料給藥法，也叫混合給藥法，是最常用的方法之壹，主要是長期使用，特別是當所用藥物不溶或不溶於水，或溶於水但適口性差時。飼料中藥物的濃度通常以毫克/千克表示。
(2)飲水給藥這是最簡單的給藥方法。在許多情況下，病鳥經常繼續喝水，盡管它們的食欲受損，甚至它們浪費食物。鳥類的耗水量因種屬不同而異，也受環境溫度和自身健康狀況的影響。因此，在計算飲水中的藥物濃度時，應根據病禽的種類、身體狀況、溫度、環境等情況隨時調整，避免藥物不足或過量進入禽類體內。飲用水中的藥物濃度通常也用毫克/升來表示。
(3)註射給藥對於已經完全放棄了對食物和飲料的食欲，並且病情嚴重的病禽，尤其是瀕臨死亡的病禽，註射給藥大概是唯壹可行的給藥方法。此外，胃腸道途徑難以吸收或不能吸收的藥物常采用此方法給藥。為保證治療效果，血中有效藥物濃度至少應維持3天。偶爾，註射過程引起的休克可能導致病禽死亡。
註射給藥包括皮下註射、肌肉註射和靜脈註射。對於壹些呼吸系統疾病，也可以使用氣管內註射或噴霧。當進行皮下註射時，通常從頸部或大腿的內部取出藥物，並進行皮下註射。胸肌常用於肌肉註射。註射入胸肌時，不要將針插入過深，以免插入胸腹腔損傷內臟，造成不必要的死亡。靜脈註射壹般取尺靜脈，翅膀不發達的鳥可以取頸靜脈。為了防止意外和血腫形成，靜脈註射的針頭要大小合適，推藥速度要慢。
(4)口服給藥是指人工將藥物通過滴管、註射器、鑷子等器械直接送入鳥口中的壹種給藥方法，常用於膠囊制劑和驅蟲藥的給藥。口服無機鹽和維生素復合物也常用這種方法給藥。
(5)體外給藥主要是指將藥粉或藥液噴塗在病禽體表的壹種給藥方法。水藥浴和沙藥浴也屬於此法。這種方法常用於控制體外寄生蟲。
(6)環境用藥法為了控制和消滅鳥類的體外寄生蟲或蚊、蠅等有害昆蟲，常選用合適的農藥，施於鳥籠、墊料、鳥巢、棲木等處。以及與鳥類生活密切相關的周邊環境。必須註意的是，大部分農藥對鳥類都有不同程度的毒性，使用時壹定要極其謹慎小心。
此外，還有壹種手術治療法，是指通過手術手段治療病禽的壹種方法，如腫瘤切除、骨折復位、異物取出、外傷修復等。，可根據具體情況采取相應的手術方法。