1.足葉草脂療法:適用於潮濕部位的尖銳濕疣，如龜頭濕疣，因包皮過長，未割包皮而發生。
2.殺病毒藥物:目前主要使用大環三萜類抗病毒藥物。大環三萜可以殺死隱藏在皮膚黏膜中的人乳頭瘤病毒病毒。這種方法療程長，疣脫落慢，但復發率很低。
3.腐蝕劑或消毒劑:常用30% ~ 50%三氯乙酸、飽和二氯乙酸或18%過氧乙酸。100ml用10%水楊酸、冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸餾水混合溶液外用於龜頭和肛周濕疣，每日壹次或隔日壹次，效果很好。消毒劑可外用20%碘酊，或2.5% ~ 5%碘酊註射疣基或外用新潔爾滅，或外用0.1% ~ 0.2%，後者需配合全身治療。
4.抗癌藥:①用2.5% ~ 5%氟尿嘧啶濕敷治療陰莖、肛門周圍尖銳濕疣。也可以聚乙二醇為基質，加入占其幹物質5%的5-氟尿嘧啶粉末制成栓劑，用於治療男性尿道尖銳濕疣。5-Fu氟尿嘧啶也可以在基地註射，很多可以分批註射。②泰替派主要用於5-Fu氟尿嘧啶治療失敗的尿道尖銳濕疣，副作用為尿道炎。也可用本品10mg加生理鹽水10ml浸泡患處，治療男性陰莖尖銳濕疣、龜頭濕疣。主要用於疣體殘留或經其他方法治療後復發的患者。也可以將這種溶液稀釋兩次，局部浸泡，防止復發。③秋水仙堿在2% ~ 8%生理鹽水溶液中外用可治療陰莖尖銳濕疣，應用後可出現淺表糜爛。
相關藥物:
鬼臼毒素酊
手術治療:
對於面積較小的單發濕疣，可手術切除；對於巨大的尖銳濕疣，可用莫氏手術切除。在手術過程中，冰凍切片被用來檢查損傷是否被清除幹凈。
其他治療:
1.冷凍療法
液氮冷凍-196℃低溫治療尖銳濕疣，可促進疣組織壞死脫落。該方法適用於數量少、面積小的尖銳濕疣。治療1 ~ 2次，間隔壹周是可行的。
2.激光療法
CO2激光燒灼術通常用於治療尖銳濕疣。此法適用於陰莖或肛門周圍的尖銳濕疣。單個或少量多發性濕疣可行壹次性治療，多發性或較大濕疣可行2 ~ 3次治療，間隔壹般為壹周。
3.電灼療法
用高頻電針或電刀去除尖銳濕疣。該方法適用於數量少、面積小的尖銳濕疣。
4.微波療法
微波外科治療機可將其桿狀輻射探頭的尖端插入尖銳濕疣並到達疣體底部進行熱輻射凝固治療。。凝結的病竈可以用鑷子取出。為了防止復發，可以將剩余的基底部分再次凝固。
5.β射線療法
療效好，無痛苦，無損傷，副作用少，復發率低，已在臨床推廣。