乙肝表面抗原(HBsAg)是乙肝病毒的外殼蛋白，不具有傳染性，但它的出現往往伴隨著乙肝病毒的存在，因此是被乙肝病毒感染的標誌。它可以存在於患者的血液、唾液、乳汁、汗液、淚液、鼻咽分泌物、精液和陰道分泌物中。在乙肝病毒感染後2 ~ 6個月和丙氨酸氨基轉移酶升高前2 ~ 8周的血清中可檢出陽性結果。大部分急性乙肝患者在病程早期可轉陰，慢性乙肝患者該指標可持續陽性。
乙肝表面抗體(抗-HBs)壹般稱為表面抗體。當乙肝病毒侵入人體後，會刺激免疫系統產生免疫反應。人體免疫系統中的b淋巴細胞分泌壹種特定的免疫球蛋白G，這是壹種表面抗體。它能與表面抗原特異性結合，然後在與人體其他免疫功能相同的作用下清除病毒，保護人體免受乙肝病毒感染。因此被稱為保護性抗體。有了表面抗體，就證明人產生了免疫力。自然感染或註射乙肝疫苗後可產生乙肝表面抗體。但不是所有人都能產生表面抗體。壹般成人感染乙肝病毒後可出現急性乙肝或無癥狀，3 ~ 6個月後大多會出現表面抗體。抗-HBs陽性時，病情已逐漸恢復。血液中的表面抗體可以維持很長時間，直到老年抗體水平才下降。如果在嬰兒時期感染了乙肝病毒，往往不會產生表面抗體，而是繼續攜帶表面抗原。有時幾年後出現抗-HBs，乙肝表面抗原逐漸轉陰。所以如果發現抗-HBs陽性結果，就意味著不會再感染乙肝。
乙肝E抗原(HBeAg)，俗稱E抗原。它來自乙肝病毒的核心，是核心抗原的亞成分，或者是核心抗原裂解的產物。抗原是壹種可溶性蛋白質。核心抗原被裂解後，可溶蛋白部分(e抗原)溶解在血清中，存在於血液循環中，如果抽血化驗就能查出。核心抗原在患者血清中找不到，只在肝細胞中存在。所以檢測E抗原相當於檢測核心抗原，說明病毒復制活躍，傳染性強。壹般來說，HBsAg (+)的人，用靈敏的固相放射免疫法檢測E抗原，可以有61%的HBsAg (+)。但如果HBsAg (+)，其意義與血液中存在病毒顆粒或血液中檢出乙肝病毒DNA或核心抗體IgM是壹樣的。
E抗體是乙肝E抗體(抗HBe)的簡稱，是用E抗原刺激人體免疫系統產生的特異性抗體。這種特異性E抗體能與E抗原結合。當乙肝患者從HBsAg (+)轉為抗HBe (+)時，稱為血清轉換。使用抗-HBe (+)時，乙肝病毒在肝組織中的復制逐漸減少，從病毒復制活躍期轉為非活躍期，肝組織炎癥常由活躍期轉為非活躍期，血液和肝組織中的病毒顆粒減少，因此傳染性也降低。但是，抗-HBe不同於抗-HBs。e抗體不是保護性抗體，不代表患者有免疫力。有時，雖然E抗體陽性，但肝細胞內仍可發現乙肝病毒DNA，說明病毒依然存在。大量研究資料表明，E抗體陽性是病毒復制減少，感染減少的標誌。此時可能病毒顆粒很少，但不代表病毒已經被消滅。
核心抗體是乙肝核心抗體的簡稱，可縮寫為抗HBc。核心抗原雖然在血清中找不到(在血液中會很快裂解)，但具有抗原性，能刺激機體免疫系統產生特異性抗體，即核心抗體。所以檢測抗HBc可以知道人體是否受到了核心抗原的刺激，即是否感染了乙肝病毒。所以抗HBc是病毒感染的標誌。
在乙肝病毒感染過程中，急性期可檢測到高抗-HBc，但急性期後，核心抗體水平仍然較高，持續數年。在慢性感染的攜帶者或患者中，核心抗體通常保持在高水平。此外，表面抗原陰性的患者也可發現抗-HBc陽性。所以單個抗-HBc陽性，很難確定患者是近期感染還是之前已經感染。
為了確定病人最近或以前是否被感染，經常需要檢測抗-HBcIgM和抗-HBcIgG。也就是說，核心抗體有兩個成分，壹個是免疫球蛋白M，壹個是免疫球蛋白G，即抗HBcIgM和抗HBcIgG。這兩種成分由不同的B淋巴細胞產生。人體受到核心抗原刺激時，先產生抗HBcIgM，持續時間短，過壹段時間後逐漸產生抗HBcIgG，後者可在體內存留較長時間。有時乙肝病毒已被清除，體內仍存在抗-HBcIgG。此時乙肝感染其他指標均為陰性，但只有抗-HBcIgG陽性。因此，當抗HBcIgM陽性時，往往預示著近期感染，即乙肝病毒仍在復制；當抗HBcIgM為陰性，抗HBcIgG或抗HBc為陽性時，說明過去有乙肝病毒感染，但沒有復制或已不存在。檢測抗HBcIgM和IgG對急性乙肝的診斷有重要意義，急性乙肝可能有兩種情況，壹種是真正的急性乙肝，即患者第壹次感染乙肝病毒，另壹種是患者以前是表面抗原攜帶者，現在急性發作，表面看起來像急性肝炎。但是，這兩個患者血液中核心抗體的情況是不同的；慢性攜帶者急性發作患者血清中抗HBcIgG或抗HBc水平相對較高，而抗HBc GM水平相對較低或略高。然而，在真正的急性乙型肝炎患者中，血清中的抗-HBcIgG往往是陰性或低的。因此，進行這種檢查有助於區分這兩種情況。鑒於其預後不同，真正的急性肝炎往往可以完全治愈，而慢性攜帶者急性發作往往容易轉為慢性。由此可見，檢測抗HBcIgM和IgG的重要性。