但是早餐空腹喝壹杯咖啡可以促進腸道蠕動，對緩解便秘非常有效。咖啡因可以阻斷腸道舒張的信號，刺激腸道肌肉加強收縮。換句話說，無論腸道是否準備好排泄，咖啡因都可以直接促進腸道蠕動，從而產生排便。
另外，長期服用便秘藥物的人，如果喜歡喝咖啡，會加重便秘，有的人可能會得腹瀉型過敏性腸綜合征。咖啡中的有益成分可以幫助排除肝臟中的毒素，所以建議適量飲用咖啡，但同時也要註意補充水分。因為咖啡中的可可堿有利尿作用，壹旦缺水，很容易加重便秘。