血栓分為動脈血栓和靜脈血栓，不同的血栓清除方法也不同。對於動脈血栓，壹般在急性期選擇導管取栓術，可快速將血栓拉出體外或應用血管內治療，用球囊和支架解決血栓問題。此外，還應添加阿司匹林、氯吡格雷等口服抗血小板藥物。慢性血栓主要通過腔內球囊和支架治療。靜脈血栓形成急性期最基本的治療是抗凝治療。對於急性血栓形成，可以應用外科治療。手術治療可分為微導管溶栓和導管抽吸。這兩種手術方法對急性期靜脈血栓形成有較好的效果。但在亞急性和慢性靜脈血栓形成時，手術效果並不理想，只需抗凝藥物即可。
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