冬天樹樁盆景的各種害蟲都不能吃，而且比較集中。所以這個季節是樹樁盆景防蟲防病的好時機。
打掃盆景園。入冬後，徹底清除枯枝、落葉、雜草、爛果等。、刮掉樹樁盆景樹枝上的翹皮、病皮、裂皮、病斑、介殼蟲等越冬蟲，及時集中焚燒，消滅越冬。
增白和害蟲控制。冬季清潔盆景園後，將10份水、3份石灰、0.5份硫磺混合原液、0.5份鹽和少量油脂混合塗抹在樹樁盆景的樹幹、樹枝和樹樁上，可殺死樹樁和樹枝的越冬。
灌溉和害蟲控制。當在樹樁和樹枝上發現蛾洞時，用註射器註入160倍的波爾多液，然後用石灰漿封洞，可有效消滅洞內害蟲。
修剪控制。結合樹樁盆景冬季整形修剪，將樹上遺留的枯枝、死果、死芽、吊繩等剪掉，對樹體進行徹底修剪(註意保持外形美觀)和清理，清理出的各種病殘物堆放焚燒。此外，衰老觀果盆景的果枝、枝幹也是越冬害蟲的隱蔽場所，在保持盆景優美姿態的同時，應及時修剪預防，進行復壯。
翻土，打農藥。冬季在樹樁盆景的盆內均勻撒上農藥土(50%辛硫磷乳油500克，細土50公斤)和海洋微生物菌劑，然後翻耕盆土，將農藥土翻入土中，毒殺盆土中的越冬害蟲。