第壹，發病原因不同。幹眼癥是由於淚液的質和量異常引起的，而慢性結膜炎是由於急性結膜炎治療不及時或感染了毒性較弱的致病菌引起的。
第二，臨床表現也不同。幹眼癥最常見的癥狀是眼疲勞、異物感、幹燥、球結膜血管擴張、球結膜失去光澤、慢性結膜炎主要表現為眼睛發癢、灼熱感、輕度結膜充血、眼瞼結膜增厚、乳頭增生。
第三，待遇不同。幹眼癥應盡量避免長時間使用手機和電腦。人工淚液如透明質酸鈉滴眼液應用於治療幹眼癥。慢性結膜炎需要消炎眼藥水，如左氧氟沙星眼藥水。必要時應檢查分泌物塗片，選擇敏感藥物治療。