1.免疫滲透分析依賴於高通數據，如RNA測序或蛋白質質譜數據。數據質量會受到實驗操作、測序儀器等諸多因素的影響，導致偏差和誤差。
2.原始信息的分析結果需要復雜的統計學和生物學解釋，不同的數據分析方法可能產生不同的結果，需要仔細驗證和進壹步研究，以確定其生物學意義。