明朝穆宗隆慶元年(公元1567年),李時珍此時已年過半百,仍帶著徒弟和兒子外出采藥。這次他註重藥用植物標本的收集,特別註意發現了歷代本草沒有記載的藥物。他試圖收集和記錄人們使用的所有藥物。比如朱砂,是今天清熱解毒的重要藥物,最早發現於李時珍時期的民間,本草有記載。其他200多種新藥,如月季花、鳳仙花、玉簪、竹葉等,都是李時珍從民間流傳的方劑中發現的,療效顯著,最早作為藥材收入《本草》中。還有《三七》,李時珍介紹:“此藥最近才出。南人軍求藥治金瘡,雲何立大功。”他還說:“凡受外傷,有瘀血者,立即嚼碎,吞之,腫消矣。”這說明當時部隊裏用三七治療棒打損傷引起的出血性疾病。同時對出血性虛脫、無名腫毒、蛇咬傷等病癥也療效顯著。三七作為壹種重要的中草藥,自李時珍在《本草》中發現以來,壹直是臨床研究的熱點。李時珍把這些藥的療效記錄下來,不僅聽人說,還親自嘗試,就像神農試百草壹樣。
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