腳趾甲長到肉裏的原因是剪指甲不正確。這是趾甲向內生長的最常見原因之壹。由於長期修剪方法錯誤，指甲變形，在指甲邊緣處掉入甲床。
長時間穿尖頭鞋，會造成雙腳拇指壹方面被鞋子擠壓，另壹方面被其他四個腳趾擠壓，使腳趾陷入指甲邊緣的甲床。不小心踢到硬物或被別人踩到後的外部原因。
可能會導致甲板的側邊更靠近甲溝的軟組織，形成向內生長的指甲。其他因素如先天性足部畸形、營養不良或經常需要直立行走的職業，如芭蕾舞演員，都會形成嵌趾甲。
當腳趾甲長入肉裏時，觸摸或按壓患處會感到疼痛，指甲周圍的甲床會潰爛腫脹，並伴有炎癥，往往會因為劇痛而無法行走。