1.病因治療最理想的治療方法是去除腎積水的病因，保留患腎。手術方法取決於病因的性質。如先天性腎盂輸尿管連接部狹窄可采用腎盂成形術，腎、輸尿管結石可采用碎石或取石術治療。這些手術近年來可以通過內窺鏡進行。術後腎積水和腎功能會有所改善。
2.如果腎造口情況危急或腎積水病因未去除，應先在梗阻上方引流，待感染得到控制後再進行去除病因的手術。當梗阻原因不能解除時，腎造口術被用作永久性治療。
3、腎切除術腎積水嚴重，剩余腎實質過少，或伴有嚴重感染，即腎性膿胸，若對側腎功能良好，可切除病變腎。