甲硝唑片用於預防和治療厭氧菌引起的感染，如呼吸道、消化道、腹腔和盆腔、皮膚和軟組織、骨和關節、心內膜炎、敗血癥和脆弱類桿菌引起的腦膜炎，也廣泛用於預防和治療口腔厭氧菌感染。這種藥也可以插入陰道，但建議在醫生指導下使用。也用於治療腸內和腸外阿米巴病，如阿米巴肝膿腫和胸膜阿米巴病。還可用於治療陰道滴蟲病、眼袋病、皮膚利什曼病、麥地那龍線蟲感染等。目前也廣泛用於治療厭氧菌感染。其最常見的不良反應是消化道反應，包括惡心、嘔吐、食欲不振和腹部絞痛，壹般不影響治療。神經系統癥狀包括頭痛、頭暈、偶見感覺異常、肢體麻木、共濟失調和多神經炎，大劑量可引起驚厥。少數病例出現蕁麻疹、潮紅、瘙癢、膀胱炎、排尿困難、口中有金屬味和白細胞減少，均為可逆性，停藥後自行恢復。
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