尿道口大囊腫會影響排尿，使尿線偏向壹側或向外展開。極少數繼發感染表面充血發紅。
小囊腫可能對日常生活沒有太大影響，但隨著囊腫的增大，會引起泌尿生殖系統的繼發感染，增加向上感染的機會，同時增大的囊腫還會引起尿道的梗阻和阻塞。建議及時去我院生殖感染科了解囊腫的大小和位置，以便制定治療方案。
目前尿道口囊腫的手術壹般采用微波治療。
微波手術刀是壹種利用微波能量進行手術的新型醫療器械。微波功率源通過帶有旋轉裝置的傳輸線與手術刀連接，使微波能量通過傳輸線沿刀片進入人體手術部位，切割人體組織並止血。手術工具是通過根據手術需要適當延伸同軸連接器的內導體而制成的具有壹定形狀的刀片。用微波治療尿道口囊腫具有止血效果好、切口不碳化、殺菌、防止手術感染等特點。，且體積小，操作靈活，特別適用於腫瘤切除、器官修復、各部位止血等外科手術。