在血栓形成中起重要作用，其主要原理是動脈硬化和纖溶抵抗。脂蛋白A可促進動脈粥樣硬化和血栓形成，是動脈粥樣硬化和血栓形成的重要獨立危險因素。
此外，它在腎小球硬化中具有壹定的致病作用，並加速腎臟疾病的進展。
治療:ω-3脂肪酸、魚油等降脂藥物可降低脂蛋白A；合成類固醇羥甲基雄酮吡唑和絕經後雌激素替代療法可降低脂蛋白A；在飲食中補充維生素C、維生素E、胡蘿蔔素等維生素或適當服用抗氧化藥物，可降低脂蛋白A在體內的毒性，從而達到預防和輔助治療動脈粥樣硬化等心腦血管栓塞性疾病的目的。