對於囊壁有小鈣化的腎囊腫患者，在沒有發現癥狀時，不需要治療，但需要定期檢查，以便更好地觀察囊腫的生長範圍，避免加重患者病情。同時通過服用壹些輔助治療和緩解的藥物，修復受損的功能，可以有效提高安全性，增加血液循環，避免阻塞血液循環，有效控制囊壁鈣化的腎囊腫。
伴有囊壁鈣化的腎囊腫可采用減壓手術治療，較適合較大的腎囊腫患者。同時這種治療方法需要進行囊腫的腹腔鏡減壓手術，可以有效控制囊腫的發展，有效保護伴有囊壁鈣化的腎囊腫患者，將損害降到最低。