黴菌性食管炎是由食管內真菌感染，大量真菌在食管黏膜內定植和繁殖而引起的炎癥。真菌性食管炎患者會出現燒心、反酸、胸骨後疼痛等明顯癥狀。胃鏡檢查時可見食管粘膜散在或彌漫性豆渣樣白苔粘連。治療真菌性食管炎的主要藥物是兩性黴素B和制黴菌素片。用法為兩片，壹日三次，咀嚼後用少量水沖服，連用5-7天。大部分患者治療效果良好，建議治療後兩周左右復查胃鏡。
真菌性食管炎患者大多是因為吞咽異物、胸骨後不適、反酸惡心、飽脹等上消化道癥狀來就診的。也可能只是上腹部不適，厭食。常規胃鏡檢查時，醫生可發現食管內有不連續的點狀、島狀白色物質附著，用水沖洗不易洗掉，細菌刷片可發現白色念珠菌、隱球菌或球孢子菌等真菌感染。