妳好，根據妳的描述，腳掌上的疣經過局部抗病毒治療後顏色變黑，可能是藥物起到了壹定的作用。但是走路的時候感覺到腳底軟組織的疼痛，可能是局部軟組織勞損引起的。適當的按摩和熱敷可以改善癥狀，必要時可以使用適當的藥物進行對癥治療。如大活絡膠囊、活血止痛膠囊等。
建議:
積極就醫，平時多休息，觀察疣的消失情況，必要時考慮激光治療。忌煙酒和辛辣食物。祝妳早日康復！