部分較小的2型房間隔缺損病例可能在出生後1年內自動閉合，出生後兩年內自動閉合的可能性極小。單純2型房間隔缺損或2型房間隔缺損伴部分右肺靜脈異位回流，肺循環血流量與體循環血流量之比超過1.5: 1，應考慮手術治療。最適合手術的年齡是4 ~ 5歲。早期手術治療可防止肺循環阻力增加和右心衰竭。嬰幼兒充血性心力衰竭，如果內科手術不能控制心力衰竭，應盡早手術。肺循環阻力明顯增加，靜息時達到6木單位以上，運動後不降低或進壹步增加。臨床上紫紺、心房水平呈反向分流，運動後動脈血氧飽和度進壹步降低，禁忌手術治療。