(1)壹般療法是隔離呼吸道，保持空氣新鮮，避免壹切能誘發痙攣、咳嗽的因素。做好護理，防止並發癥。註意營養。
(2)在卡他期或早期痙攣期應用抗生素治療，可降低傳染性，緩解癥狀，縮短病程。
2.對癥治療
祛痰劑和鎮咳劑，如氯化銨。0.5mg/kg沙丁胺醇可緩解咳嗽癥狀。氯丙嗪可以減少夜間咳嗽，有利於睡眠。嬰兒窒息時，應立即進行人工呼吸，必要時吸氧、解痙、祛痰。靜脈輸註普魯卡因，1 ~ 2次，每日3 ~ 5天，可減少窒息或驚厥，同時註意心率和血壓。脫水劑可用於百日咳腦病。當出現低鈣和低血糖時，應給予對癥治療。
3.並發癥的治療
根據共病種類，給予相應的治療。
4.皮質甾類
它僅在危重患者中短期使用，如嬰兒或腦病患者。潑尼松龍口服。或者通過靜脈註射氫化可的松。註意激素的副作用。
5.外部摩擦療法
將新鮮生姜或大蒜切片，粘上蝸牛液或蛋清，自上而下在胸骨上摩擦，每日兩次，每次1，持續數分鐘。