年齡、細菌感染和藥物因素。
1.細菌感染:食物殘渣容易引起細菌，在細菌的作用下，會慢慢腐爛，變硬，形成結石。
2.藥物因素:高血壓藥物、止痛藥、抗抑郁藥等處方藥也會引起扁桃體結石。這是因為這些藥物的副作用會使口腔幹燥，這意味著扁桃體中沒有足夠的唾液來沖走食物和細菌。當鈣化的食物、粘液和細菌形成的腫塊殘留在扁桃體的凹陷處時，就會形成扁桃體結石。
3.年齡:成人扁桃體較大，扁桃體表面凹凸不平。隨著扁桃體的生長，這些“凹坑”會變得更大，使食物更容易留在其中並形成結石。
款待
1.小結石:可用刮匙或鉗子取出，部分可用負壓吸引取出。
2.大結石:表面麻醉下切開黏膜取出，但需防止掉入呼吸道。
3.局部治療:如果是結石刺激引起的外周炎癥，可使用消炎藥進行局部治療，如漱口消除扁桃體結石。或者將藥物直接塗於下頜骨、扁桃體的相應部位，達到清熱解毒、消腫散結的目的。
4.切除:對於頑固性扁桃體結石，如果保守治療無效，可以考慮進行扁桃體切除術，消除咽部不適和口臭。