中醫壹般調理過程比較慢，而甲狀腺炎壹般發病比較急。用中藥調理也很有可能延緩病情，導致更嚴重的狀態。比如亞急性甲狀腺炎本身就不需要特殊治療。除非病情嚴重，疼痛難以忍受，否則可以使用壹些非甾體抗炎藥，如布洛芬，進行鎮痛治療。難以控制時，可適量使用壹些糖皮質激素。
急性甲狀腺炎可用抗菌藥物控制，病情嚴重時可用手術切開排膿。橋本甲狀腺炎目前無法治愈，中藥療效有限。