如有疼痛，可用雙氯芬酸鈉噴喉，用連翹敗毒片清熱解毒，改善癥狀。也有可能考慮病毒性口腔潰瘍或皰疹性咽峽炎。建議註意飲食清淡，適當口服抗生素和抗病毒藥物對癥治療，局部使用西瓜霜噴喉。
長在喉嚨裏的小水泡主要靠口服藥物消除。對於不同疾病引起的水泡，口服藥物的種類是不同的。
咽喉部的水皰主要是受炎癥刺激後水腫增生所致，壹般長在咽喉後壁或舌根處。如果這種水皰是咽喉部淋巴濾泡增生，可以用具有清潔殺菌作用的漱口水沖洗，或者霧化。做霧化治療的時候，也可以配合壹些口服藥物。如果這個淋巴濾泡長期得不到緩解，嚴重的話就要手術切除。
如果是病毒感染引起的喉部皰疹，需要口服抗生素或抗病毒藥物來消除，因為這些皰疹會引起喉部劇烈疼痛，引起吞咽困難，還可能出現發燒的癥狀。服藥時註意多喝水，適當休息。
平時要經常鍛煉，預防感冒，因為感冒後如果短時間不好好，可能會引起扁桃體炎，加重咽喉部水泡的生長。