通過組織培養技術獲得的人工種子與天然種子相比具有以下優點:
1.復制速度快，結構完整。
2.“種皮”的不同成分可以根據不同植物的生長需求進行配置。
3.在苗木的大量繁殖和人工造林方面，人工種子比試管苗的繁殖方法更能降低成本，而且便於機械化播種，可以節省勞動力。
4.體細胞胚是無性繁殖系統產生的，所以雜種是可以固定的。
5.有時壹些農藥、菌肥、有益微生物、激素等。可以添加到人工種子中，具有更好的營養供給和抗病性，從而獲得更旺盛生長的可能。
6.胚狀體發育的方式可以作為基因工程和高等植物基因工程之間的橋梁。
7.解決了部分作物品種繁殖能力差、結實困難或發芽率低的問題。
8.不受季節限制，更快培育新品種是可能的。
9.能完整保持優良品種的遺傳特性，生產不受季節限制。
10.大小壹致，落種均勻，出苗整齊。
11.儲存運輸方便。
12.所用培養基具有數量少、體積小、繁殖快、萌發成苗快、便於運輸和儲存的特點。
13.人工種子技術適用於種質資源難以保存、遺傳性狀不穩定或育性差的珍稀樹種的繁殖。
14.人工種子可以克服無性繁殖造成的病毒積累，可以快速繁殖出無病毒苗。