糖皮質激素類藥物主要用於抗炎、抗病毒、抗休克和免疫抑制治療，在各科多種疾病的診治上廣泛應用，但臨床不合理應用非常突出。
《原則》指出，糖皮質激素類藥物在臨床上未嚴格按照適應證給藥的情況較為普遍。如單純以退熱和止痛為目的，特別是在感染性疾病中以退熱和止痛為目的使用，均屬未嚴格按照適應證給藥。盡管糖皮質激素有抑制自身免疫的藥理作用，但並不適用於所有自身免疫病治療，比如慢性淋巴細胞浸潤性甲狀腺炎（橋本病）、1型糖尿病、尋常型銀屑病等。
《原則》要求，合理應用糖皮質激素應綜合患者病情及藥物特點，選用適當的品種、劑量、療程和給藥途徑等。應監測糖皮質激素的不良反應，註意停藥反應和反跳現象。孕婦應慎用糖皮質激素，大劑量使用糖皮質激素者不宜懷孕。對糖皮質激素類藥物過敏，有嚴重精神病史，癲癇、骨折、嚴重高血壓和糖尿病等患者要盡量避免使用糖皮質激素。
《原則》還對糖皮質激素的臨床應用管理提出了相關要求：沖擊療法（療程少於5天，適用於危重癥病人的搶救）需具有主治醫師以上者決定；長程糖皮質激素治療方案，需由相應學科主治醫師以上者制訂；先天性腎上腺皮質增生癥的長程治療方案制訂，需三級醫院內分泌專業主治醫師以上者決定；緊急情況下臨床醫師可以高於上述權限使用糖皮質激素，但僅限於3天內用量，並嚴格記錄救治過程。