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北京友誼醫院始建於1952年，原名為北京蘇聯紅十字醫院，是新中國成立後，在蘇聯政府和蘇聯紅十字會援助下，由黨和政府建立的第壹所大型醫院。1954年新院址落成，毛澤東、周恩來、劉少奇、朱德等老壹輩革命家為醫院親筆題詞。
毛澤東主席特別題詞“減少人民的疾病，提高人民的健康水平”。1957年3月，蘇聯政府將醫院正式移交我國政府，周恩來總理親自來院參加了移交儀式。1970年，周總理親自為醫院命名為“北京友誼醫院”。
北京友誼醫院是集醫療、教學、科研、預防和保健為壹體的北京市屬三級甲等綜合醫院，是首都醫科大學第二臨床醫學院。醫院設有西城院區和通州院區，其中西城院區位於首都核心區，通州院區位於城市副中心。