1953年10月5日，黃建始出生於壹位中學教師家庭。2011年8月16日淩晨2:40，北京協和醫學院公***衛生學院院長、流行病學專家黃建始教授在美國洛杉磯凱澤醫院不幸因病去世。 1966年畢業於三裏街小學（現逸夫小學）。“文革”期間，隨父母上放農村，續學於三湖公社珠湖大隊小學附設初中班、三湖公社中學。1973年畢業於其父任教的玉山中學高中部（現玉山壹中），再次被下放到玉山良種場知青分場，做過農工、出納、會計、赤腳醫生和報道員。後被招工到江西光學儀器總廠，在六分廠做機修鉗工。
1978年，黃建始考取廣州中山醫學院（即現在的中山醫科大學）。在校期間，他不但連續三年獲“三好學生”稱號，1979年還被評選為廣東省優秀大學生，而且參與了全國第壹份醫學生雜誌《中國醫學生》的創辦工作，且是該刊物的主要編輯和撰稿人之壹。同時，他也是國家優秀科技期刊、全國發行量最大的醫衛科普雜誌《家庭醫生》的創始之壹，並壹直擔任該刊的記者和撰稿人。1983年醫大畢業，他被選派進北京中央衛生部工作。1986年考取世界衛生組織獎學金（WHO Fellowship），到美國芝加哥伊利諾大學深造。1988年獲醫學教育管理碩士後繼續攻讀衛生資源管理博士學位，以優秀成績修完博士課程（GPA：4.95/5.00）。1989年，他放棄讀完博士學位而改攻第二碩士學位。1990年獲伊利諾大學公***衛生（流行病學）碩士學位。在留美學習時，黃建始曾任該校中國留學生和訪問學者聯誼會主席，連續兩年獲得校長學生服務獎，以及JohN and Grace國際優秀學者獎和Marin Gershon紀念獎。 二十世紀八十年代後期和九十年代，黃建始醫師先後在美國、加拿大多所大學和衛生部門從事科研、教學和衛生行政管理工作。他還參與了加拿大流行病學和生物統計學學會的創立工作，是加拿大薩省針灸學會的發起人和第壹副會長，也是薩省流行病學報告（雜誌）的編委；曾應邀為美國醫學會雜誌（JAMA）審稿。他現為國際流行病學學會、美國醫學學會、美國公***衛生學會會員。
黃建始醫師在過去十幾年中發表了數十篇文章，獨立編寫和參與編寫了五本中英文書籍。他受聘擔任過中、加、美三國8個專家工作小組或委員會成員。他任加拿大阿爾伯特王子城開發公司工商顧問時，曾率該公司主要管理人員訪問中國，促進中加合作。1996年，他專程回到母校中山醫科大學，探討如何更好地開展合作交流。1997年，中山醫科大學聘請他為該校流行病學學術顧問。由他任海外總編輯的《家庭醫生》國際版也已問世。
黃建始又於1997年5月獲得美國俄亥俄州Ashland大學的工商管理碩士學位，現為美國佛裏達州衛生廳達德郡衛生局的流行病學專家，與妻子蕭進博士及兩兒壹女住在佛羅裏達州邁阿密市。同年8月，出版了專著《英特網探奇》。先後在美國和加拿大三州壹省地方政府衛生局任流行病學專家和部門負責人，聯邦和州省政府公***衛生顧問，並兼教於美加三所大學。
2003年5月4日應科技部和衛生部領導邀請回國參與防控SARS工作。現從事健康管理和中國突發公***衛生應對體系建設的研究，包括臨床醫學和公***衛生整合，循證公***衛生，健康教育和科普創作等。